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导师

王岩琦

王岩琦(wangyanqi@genomics.cn),13311i多组学智慧实验平台研发负责人,“梧桐菁英”科技创新企业人才,毕业于哥伦比亚大学Chemical Engineering专业,持续深耕自动化、信息化、智能化,并将其运用在疾病预测领域。在该领域拥有核心专利软著十余项,落地国内首套临床NIPT全流程自动化产线、哈尔滨龙江智“惠”实验室等一批具有国际技术先进性的标杆项目,多次被国内知名媒体报道。组内涉及自动化、智慧工厂中控系统、分子生物学临床应用、质谱临床应用、智慧影像、多组学综合分析等多个交叉学科,并持续引入新技术、新平台进行临床应用转化。2018-2020年作为项目执行负责人,完成国内首套百万通量级临床测序全自动产线研发、验证及投产(集团战略项目),打破该细分领域被进口供应商垄断的状态,获华大集团最高项目荣誉“华表奖”。2021-2023年提出“以功能岛为基本单元的级联黑灯工厂”技术体系,于2021年完成首套“中小通量智慧实验室单体功能岛研发”(公司级项目)并完成投产及技转。2022年完成分子生物学全流程自动化流水线项目迭代研发,获深圳市工业和信息化局2022年深圳市企业技术中心建设项目资助(公示于“2021年深圳华大医学检验实验室申报深圳市企业技术中西扶持项目”的子项目)。同期,攻克结直肠癌筛查中出现的“粪便样本前处理”行业难题,研发完成粪便前处理一体机;并将技术体系由基因组检测技术拓展至质谱检测技术,完成质谱样本前处理一体机研发,获第一类医疗器械备案(粤深械备 20221823)。在疫情期间参与编写自动化实验流程并深入一线支援抗疫工作,作为石家庄抗疫团队成员获河北省政府“2021年抗击河北石家庄疫情最美逆行者”荣誉称号,2023年完成“平疫转换”相关技术开发,该技术可将疫情后的核酸提取及qPCR产能转化为肠癌早筛、HPV筛查等民生项目产能,助力“健康中国2030”目标达成。2023年至今,负责内部“13311i”战略专项,该技术体系关联融合了多个组学平台,在“症状体征”出现之前,有效筛查出重大疾病的欲病和已病人群,有效降低社会疾病负担,提升人民健康水平。推动医疗工作“从以治病为中心转变为以人民健康为中心”。同一期间(2023年至今),为满足该疾病预测AI大模型的建设,建立多组学数字仓库,初步完成大人群健康多组学数据治理基础设施建设,拉通多部门,研发建设“可预测、可量化、可闭环治疗”的疾病防控技术体系。并在同年(2023年)实现13311i主动健康实验室落地,该系统基于智慧工厂多岛系统,整合了包括基因组、代谢组、免疫组、生化组、影像组在内的多组学检测体系,落地于深圳华大时空中心,获人民日报等多家媒体报道,同步完成多项底层技术研发(含硬件自研、电气模块化、智能排程系统、多岛串接系统等),通过“自研+合作开发”拉起国产供应链,实现智慧工厂设备、控制软件及信息系统从进口到国产的转变,实现中国智造。

研究方向:

课题一、医学图像数据处理与分析算法

1、课题内容:医学图像数据包括超声、核磁、CT、眼底等设备采集数字图像,本课题将分成两部分进行,即处理和算法分析。(1)数据处理部分将对多源数据进行数据工程学习、应用,完成对DICOM格式、关键信息提取、数据管理等清洗和归档工作,涉及数据挖掘基础工具使用,如:R、python等,理工科背景推荐。(2)数据算法部分将对多源数据进行多模态算法搭建、训练、调参等,完成对影像组学数据的高级特征进行工作,涉及机器学习、深度学习工具使用,如:TensorFlow、Pytorch等,理工科推荐,能将算法提供服务,有工程化经验加分,医学背景加分。

2、课题团队:该课题挂靠华大集团战略专项——13311i专项,旨在通过多组学联合分析建立疾病预测算法借此理解疾病发生发展的过程,以技术手段实现个人疾病风险降低、生物学年龄逆龄,以达成对疾病的主动防控。

3、基础要求:(1)对人工智能技术在心脑血管疾病、神经退行性疾病、肿瘤等重大疾病的应用感兴趣,学习能力强(2)具备基本的代码能力,会用Python,有医学或影像相关的科研项目经验(3)有较强的文献和专利的调研能力(4)专业排名前20%内

课题二、多模态组学数据与疾病风险关联性分析

1、 课题内容:在不同时间、同一个人的医学图像数据中超声、核磁、CT、眼底等图像拥有不同模态的组学特征,本课题将着重发掘不同模态之间的组学差异、建立健康基线模型、发掘疾病因子,形成一套多模态影像组学工具、数据集、集成平台等。涉及机器学习、深度学习工具使用,如:TensorFlow、Pytorch等,医学背景优先;理工科推荐,能将算法提供服务,有工程化经验加分。具体任务包含(1)i99、哈尔滨等队列项目以影像组为基础的多组学数据挖掘以及相关数据的整理、文章撰写;(2)多模态数据分析,构建疾病因子模型,整理结果(3)文章调研,心脑血管疾病、神经退行性疾病、肿瘤等重大健康负担相关知识库构建

2、课题团队:该课题挂靠华大集团战略专项——13311i专项,旨在通过多组学联合分析建立疾病预测算法借此理解疾病发生发展的过程,以技术手段实现个人疾病风险降低、生物学年龄逆龄,以达成对疾病的主动防控。

3、基础要求:(1)对人工智能技术在心脑血管疾病、神经退行性疾病、肿瘤等重大疾病的应用感兴趣,学习能力强(2)具备基本的代码能力,会用Python,有医学或影像相关的科研项目经验(3)有较强的文献和专利的调研能力(4)专业排名前20%内

现任岗位:华大股份 智惠医学研究院 13311i专项 专项负责人

教育背景:哥伦比亚大学Chemical Engineering硕士

参与项目:

1.自动化项目:首套NIPT全流程自动化产线开发、哈尔滨龙江智惠实验室研发

2.黑灯工厂中控:PMS中控系统开发

3.应用开发(基因组、代谢组):十百千万功能岛及质谱仪设备流程开发及测试、华大员工i99主动健康项目

4.影像组:多模态影像大模型平台搭建

论文:

1.Zhong H, Zeng L, Tao M, Ye Y, Wang Y, Hou L, Wu M, Liu H, Zhang H, Tang M. A novel method for extracting circulating cell-free DNA from whole blood samples and its utility in the non-invasive prenatal test. Prenat Diagn. 2022 Aug;42(9):1173-1181. doi: 10.1002/pd.6212. Epub 2022 Aug 5. PMID: 35818872; PMCID: PMC9541415.

专利:

1.“一种用于自动化测序文库制备的功能岛设备”、“一种研磨珠批量分装机构及设备”、“样本前处理控制软件(V1.1.0)”等核心技术相关专利、软著十余件。


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