吴频(wupin@genomics.cn),博士,生物信息副研究员。曾获得2022年上海市遗传学会青年遗传学家论坛三等奖,2022年“锦江-恺思”卓越人才奖学金等奖项。
研究方向:肿瘤演化与免疫微环境
现任岗位:华大研究院 西南分院 精准所 疾病图谱研究 生物信息副研究员
教育背景:上海科技大学 生物学 博士
参与项目:
1.三阴性乳腺癌(TNBC)的空间演化轨迹构建:
整合激光捕获显微切割微克隆细胞团的空间信息和多组学数据,解析瘤内异质性,探索肿瘤与微环境表型是否存在协同演化的现象、寻找驱动转移进程的分子机制
2.肝细胞肝癌(HCC)的大队列和多组学研究:
收集了迄今为止最大的HCC转移灶的多区域取样队列,整合分析大规模多组学数据以了解HCC转移进程,回答相关生物学问题;
描绘HCC的时间和空间进化轨迹、转移播种模式、播种时间,筛选转移相关标志物。
3.开发重构肿瘤进化过程的算法:PTI :
提出一种新颖且易于使用的方法PTI,它使用一种自上而下的迭代方法,无需突变频率信息,仅使用体细胞变异的存在/缺失模式来推断同一患者的多个肿瘤样本间的进化关系
论文:
1.Sun Y, Wu P, Zhang Z, et al. Integrated multi-omics profiling to dissect the spatiotemporal evolution of metastatic hepatocellular carcinoma. Cancer Cell. 2024 [共同第一作者]
2.Wu P*, Hou L, Zhang Y, Zhang L. Phylogenetic Tree Inference: A Top-Down Approach to Track Tumor Evolution. Front Genet. 2020 [*第一作者]
3.Sun Y F, Wu P, et al. Multiregional sequencing reveals the heterogeneity and underlying complex evolutionary history in liver cancer metastasis[J]. Cancer Res. 2020, 80 (16_Supplement): 3628-3628.


