郭金旦（guojindan@genomics.cn），博士。曾获得北京师范大学研究生学术创新奖、新生奖学金、学业一、二、三等奖学金；2014-2015年数学教育基金一等奖、四通奖学金、第六届全国大学生数学竞赛（数学类）三等奖、第七届“认证杯”数学中国数学建模网络挑战赛全国比赛三等奖；2012-2014优秀学生一等奖学金、学生标兵、暑期社会实践优秀队员、国家励志奖学金、四通奖学金。
研究方向：宏病毒组，宏基因组，生物信息学
现任岗位：华大研究院 北京分院 精准所 生物信息副研究员
教育背景：北京师范大学 生态学 博士
参与项目：
1.2024年1月-至今，参与国家重点研发计划-病原学与防疫技术体系研究-潜在威胁人类病原体发现与挖掘研发项目，通过使用高通量测序技术，对野生动物中的病毒多样性、重组和跨地域传播特征进行了大规模的调查。通过这项研究，团队揭示了多种新型病毒，为全球病毒多样性研究领域提供了新的数据和视角，同时也对全球公共卫生安全做出了重要贡献。通过获取动物来源样本的病原基因组数据，鉴定新的人畜共患病原，识别病原分布热点和预测潜在的跨物种事件；
2.2024年1月-至今，参与城市化对北京市地表水微生物组及抗生素抗性基因的影响及机制研究，对比北京市高低城市化中的浮游与底泥微生物的群落结构与功能基因差异，探究城市化对地表水微生物组的影响，旨在揭示超大城市地表水微生物群系的整体特征、功能潜力和驱动因素，为城市水生态管理与保护提供理论参考，为保障水质安全、构建可持续城市水系统奠定基础；
3.2021年8月-2024年1月，参与了中国医学科学院医学与健康科技创新工程——重大神经精神类疾病动物模型资源库的建立，该项目是中国医学科学院医学与健康科技创新工程的重要组成部分，专注于神经精神类疾病的发病机制研究。通过构建和分析动物模型，项目旨在深入理解这些复杂疾病的生物学基础，并探索新的治疗策略，项目不仅为科研人员提供了宝贵的动物模型资源，还建立了一个全面的比较医学数据库，这将极大地促进致病机制的发现、药物靶点的识别以及治疗方法的有效性评估。通过整合实验动物模型数据和生物信息分析流程，搭建动物实验生物信息研究提供数据-方法-平台一体化的研究范式，为实验动物数字化发展提供研究基础；
4.2021年8月-2024年1月，参与了国家重点研发计划青年科学家项目——标准物质研制的实验动物质量评价关键技术研究，项目致力于开发和优化实验动物在生物医学研究中的标准化使用。项目任务包括制定实验动物的质量和健康标准、评估其对科学研究的影响、以及开发新的质量控制技术。目标是提高实验动物的一致性和可靠性，确保实验结果的准确性和可重复性；
5.2022年6月-2023年9月，参与了京津冀基础研究合作专项——2型糖尿病微血管病变多维数据整合及风险预警模型构建研究，研究将为糖尿病微血管病变的早期预测、诊断和治疗提供研究基础，建立稳定合作的京津冀三地糖尿病血管病变临床-流行病学-大数据研究团队,实现强-强联合，建立共享的生物样本库、临床资料库和多组学数据库。项目将在队列研究中揭示糖尿病微血管病变的独立风险因素、建立多维数据资料整合的风险因素评估模型，以指导糖尿病微血管病变的精准医疗和预防；
6.2021年8月-2023年4月，参与了国际（地区）合作与交流项目——适应性细胞免疫对新冠病毒SARS-CoV-2免疫保护作用的跨学科框架研究，基于实验动物模型，深入研究细胞免疫反应，并收集相关的临床数据、实验室数据和流行病学数据，进行综合分析，实现理解适应性细胞免疫在SARS-CoV-2感染中的反应机制的目标，对开发新的治疗策略，增强对SARS-CoV-2的治疗效果，推动不同学科间的知识和技术交流；
论文：
1.Guo J, Pang E, Song H, et al.. A tri-tuple coordinate system derived for fast and accurate analysis of the colored de Bruijn graph-based pangenomes. BMC Bioinformatics. 2021;22(1):282.
2.Guo J, Shi W, Li X, Yang B, Qin C, Su L. Comparative Analysis of Gut Microbiomes in Laboratory Chinchillas, Ferrets, and Marmots: Implications for Pathogen Infection Research. Microorganisms. 2024;12(4):646.
3.Li B, Guo J, Hu W, et al.. Binding affinity improvement analysis of multiple-mutant Omicron on 2019-nCov to human ACE2 by in silico predictions. J Mol Model. 2023;29(5):155.
4.Han X, Guo J D, Pang E L, et al. Ab Initio Construction and Evolutionary Analysis of Protein-Coding Gene Families with Partially Homologous Relationships: Closely Related Drosophila Genomes as a Case Study. Genome Biol Evol. 2020 Mar 1;12(3):185-202.
5.Zhang L, Guo J, Liu J. Era of the 4D animal model. Animal Model Exp Med. 2023;6(2):178-182.
6.Li B, Guo JD, Zhang J, et al. The Diversity and Heterogeneity of TCR and BCR in Pan-Cancer. Immunotherapy (Los Angel). 2022; 08:193.
7.郭金旦，高艳艳等. 2型糖尿病风险预测模型性能比较研究[J].中国生物工程杂志, 2023, 43(11):35-42.
专利：
1.基于病毒结构蛋白生物活性成分筛选系统（在申）
2.基于图的泛基因组数据组织方法（在审）
3.基于图的多序列比对方法及其系统（在审）
软著：
1.《冠状病毒变异与进化分析软件》,2023SR0129490
2.《冠状病毒变异与进化分析软件》, 2023SR0129489
3.《2型糖尿病高通量测序数据易感位点分析》，2023SR0129488
