张莹(zhangying7@genomics.cn),在华大时空组学项目中担任算法工作,专注解决新技术产品化中的实际挑战。工作涉及图像处理、深度学习和生物信息等领域。在工作过程中,不仅积极探索,还成功发表了多篇专利和论文,丰富了专业经验,期间也有指导研究生的经验。
研究方向:数据分析,图像处理,生物信息
现任岗位:华大研究院 三箭齐发 生物信息副研究员
教育背景:中国科学院大学 光学工程 博士
论文:
1.Shen, R., Liu, L., Wu, Z. et al. Spatial-ID: a cell typing method for spatially resolved transcriptomics via transfer learning and spatial embedding. Nat Commun 13, 7640 (2022).
2.Chao Zhang, Lin Liu, Ying Zhang, Mei Li, Shuangsang Fang, Qiang Kang, Ao Chen, Xun Xu, Yong Zhang, Yuxiang Li, spatiAlign: an unsupervised contrastive learning model for data integration of spatially resolved transcriptomics, GigaScience, Volume 13, 2024, giae042.
3.Tongxuan Lv, Ying Zhang, Mei Li, Qiang Kang, Shuangsang Fang, Yong Zhang, Susanne Brix, Xun Xu, EAGS: efficient and adaptive Gaussian smoothing applied to high-resolved spatial transcriptomics, GigaScience, Volume 13, 2024, giad097.


