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导师

王洁雨

王洁雨(wangjieyu@genomics.cn),国家基因库/华大生命科学研究院生物信息副研究员,植物学博士,Tropical Plants 杂志青年编委,曾工作或联培于中国科学院、国家兰科中心、以及比利时根特大学。参与研究课题包括深圳拟兰、春兰、角苔、山苍子、枸杞、杉木、番荔枝等基因组研究,兰科、蝴蝶兰属系统分类学与生物地理学,被子植物起源与分化机制,物种杂交起源等。主要研究方向是:比较基因组学分析、生命科学大数据分析与应用、基于人工智能的科学数据应用。在进化生物学、系统进化与生物地理学、比较基因组学与生物信息学等交叉领域深耕多年,研究论文发表于Nature、Nature plant、Nature communication等杂志。发表SCI论文29篇,主编专著1本。

研究方向:被子植物起源与进化的基因组示踪

课题基于海量基因组数据,开展演化生物学、生物地理学、基因组进化、泛基因组、与比较基因组学研究,揭示被子植物演化进程中的基因组动态,届时其起源与分化历史。基于以上数据与研究结果,开展数据应用与科普工作。

团队配备科学数据科研人员,生物信息分析师,专业数据产品运营与科普团队,数据库与软件前后端开发人员,以实现生物数据二次挖掘及在科学与公众领域的流通。团队开发国家基因库生命大数据平台,开放共享遗传资源信息,支持全球科研工作者共享数据,与国内外主要数据库和样本库合作互联互通。

作为广东省基因组科学数据中心依托单位,累计支持560多家机构1,500多篇学术论文在300多本国际期刊上发表,归档数据量超16PB,在全球同类数据库中排名第五。此外也获得国内首个CoreTrustSeal(CTS)全球核心可信存储库国际认证,成为国际科学理事会(ISC)世界数据系统(WDS)在生物信息领域的首个正式会员。

现任岗位:华大研究院 国家基因库专项 数据共享中心 生物信息副研究员

教育背景:华南农业大学 植物学 博士

参与项目:

1.科研项目“深圳拟兰与兰科植物演化”
2.科研项目“山苍子基因组与樟科植物演化”
3.科研项目“舌蛇兰比较基因组与腐生特性的演化”
4.科研项目“⻆苔基因组与陆生植物演化”
5.科研项目“报春苣苔属繁育系统转换”
6.科研项目“球花石斛基因组学”
7.科研项目“三白草基因组与传粉策略分子机制”
8.广东省林业科技创新项目“深圳香荚兰种质资源收集与繁育利用”
9.深圳市基础研究项目“小兰屿蝴蝶兰遗传图谱构建及形状基因挖掘”
10.广东省科技创新项目“海南吊罗山植物图鉴编研”

论文:

1.Zhang G Q, Liu K W, Li Z, et al. The Apostasia genome and the evolution of orchids[J]. Nature, 2017, 549(7672): 379-383.
2.Wang J Y, Liu Z J, Wu X Y, et al. Bulbophyllum lipingtaoi, a new orchid species from China: evidence from morphological and DNA analyses[J]. Phytotaxa, 2017, 295(3): 218-226.
3.Zhang J, Fu X X, Li R Q, et al. The hornwort genome and early land plant evolution[J]. Nature plants, 2020, 6(2): 107-118.
4.Li M H, Liu K W, Li Z, et al. Genomes of leafy and leafless Platanthera orchids illuminate the evolution of mycoheterotrophy[J]. Nature Plants, 2022, 8(4): 373-388.
5.Chen Y C, Li Z, Zhao Y X, et al. The Litsea genome and the evolution of the laurel family[J]. Nature Communications, 2020, 11(1): 1675.
6.Wang J, Liu Z, Zhang G, et al. Evolution of two ubiquitin-like system of autophagy in orchid[J]. Horticultural Plant Journal, 2020, 6(5): 321-334.
7.Chen B J, Wang J Y, Zheng P J, et al. Dendrobium thyrsiflorum genome and its molecular insights into genes involved in important horticultural traits[J]. Plant Biotechnology Journal, 2024
8.Liang Y, Hao J, Wang J, et al. Statistical Genomics Analysis of Simple Sequence Repeats from the Paphiopedilum Malipoense Transcriptome Reveals Control Knob Motifs Modulating Gene Expression[J]. Advanced Science, 2024: 2304848.
9.Gao R F, Wang J Y, Liu K W, et al. Comparative analysis of Phytophthora genomes reveals oomycete pathogenesis in crops[J]. Heliyon, 2021, 7(2).
10.Yi H, Wang J, Wang J, et al. Genomic insights into inter‐and intraspecific mating system shifts in Primulina [J]. Molecular Ecology, 2022, 31(22): 5699-5713.


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