唐珊媚（tangshanmei@genomics.cn），基因组学专业，中级职称，从事高通量测序技术的基因组信息学分析工作11+年。有丰富的大队列人群研究经验，主要研究方向为人基因组、微生物宏基因组、代谢组、单细胞时空组学等，擅长多组学联合研究。参与多项国家自然科学基金项目和自主科研项目。已发表SCI文章13篇，涉及Nature Biotechnology，Nature Medicine，Nature Aging，Cell Discovery等多篇杂志。获得发明专利1项，软件著作权5项。
研究方向：宏基因组学、基因组学、单细胞时空组学、生物信息学
现任岗位：华大集团 科研合作部 医学研究负责人 信息分析高级工程师
教育背景：中南大学 基因组学 硕士
参与项目：
1.国家自然科学基金青年科学基金项目，C060702，基于宏基因组测序数据的原核微生物泛基因组网络构建及其可视化方法研究，2013/07-2019/12，核心参与人员。
2.牛瘤胃微生物宏基因组基因集项目，2014-2016，核心参与人员。
3.婴幼儿肠道微生物宏基因组项目，2015-2017，核心参与人员。
4.健康人群基因组宏基因组多组学研究项目， 2017/07 - 2019/9，核心参与人员。
5.HPV感染多组学研究，2019.10 - 2021.9，核心参与人员。
6.利用宏基因组分析菌群多态性在胚胎停育中的作用，2019.10 - 2021.9，项目负责人。
7.青年群体人格特质的神经影像遗传多组学项目， 2021.10 - 2025，项目负责人。
8.吸烟成瘾人群基因组学研究， 2023.9 – 2026，项目负责人。
9.高原人群多组学研究， 2023 – 2026，项目负责人。
10.糖尿病小鼠模型单细胞时空多组学研究，2024.9 – 2027，项目负责人。
论文：
1.Fang Huang, Shanmei Tang, Charles X. Ling. Extracting Academic Activity Transaction in Chinese Documents. ISKE, 2014 (International Conference on Intelligent Systems and Knowledge Engineering).
2.Ye Peng; Shanmei Tang; Dan Wang; Huanzi Zhong; …; Jian Wang; Karsten Kristiansen, Xun Xu; Junhua Li. MetaPGN: a pipeline for construction and graphical visualization of annotated pangenome networks. GigaScience. 2018 Nov 1;7(11). doi: 10.1093.
3.Xiaomin Liu, Shanmei Tang, Huanzi Zhong, Xin Tong, Zhuye Jie, Qiuxia Ding,…, Weibin Liu, Xiao Liu, Yong Zhang, Susanne Brix, Karsten Kristiansen, Yong Hou, Huijue Jia, Tao Zhang. A genome-wide association study for gut metagenome in Chinese adults illuminates complex disease. Cell Discovery. 2021 Feb 9;7(1):9. doi: 10.1038/s41421-020-00239-w.
4.Xuan Zhang, Dongya Zhang, Huijue Jia, Qiang Feng, Donghui Wang, Di Liang, Xiangni Wu, Junhua Li, …,, Weineng Chen, Shanmei Tang, …, Xun Xu, Ye Yin, Huanming Yang, Jian Wang, Karsten Kristiansen, Liang Liu, Ting Li, Qingchun Huang, Yingrui Li & Jun Wang. The oral and gut microbiomes are perturbed in rheumatoid arthritis and partly normalized after treatment. Nature Medicine, 2015,21(8):895-905.
5.Yuanqiang Zou, Wenbin Xue, Guangwen Luo, Ziqing Deng, Panpan Qin, Ruijin Guo, Haipeng Sun, …, Yuxiang Lin, Shanmei Tang, …, Junhua Li, Huijue Jia & Liang Xiao. 1,520 reference genomes from cultivated human gut bacteria enable functional microbiome analyses. Nature Biotechnology. 2019 Feb;37(2):179-185. doi: 10.1038/s41587-018-0008-8.
6.Daoming Wang, Yan Li, Huanzi Zhong, Qiuxia Ding, Yuxiang Lin, Shanmei Tang, Yang Zong, …, Rong Wang, Xiao Liu. Alterations in the human gut microbiome associated with Helicobacter pylori infection. FEBS 2019. doi.org/10.1002/2211-5463.12694.
7.Junhua Li, Huanzi Zhong, Yuliaxis Ramayo-Caldas, Nicolas Terrapon, Vincent Lombard, Gabrielle Potocki-Veronese, Jordi Estell´ e5, ..., Shanmei Tang,…, Bernard Henrissat, Stanislav D. Ehrlich1 and Diego P. Morgavi. A catalog of microbial genes from the bovine rumen unveils a specialized and diverse biomass-degrading environment. GigaScience. 2020 Jun 1;9(6):giaa057. doi: 10.1093/gigascience/giaa057.
8.Xiuying Zhang, Huanzi Zhong, Yufeng Li, Zhun Shi, Huahui Ren, Zhe Zhang, Xianghai Zhou, Shanmei Tang, Xueyao Han,…,, Junhua Li & Linong Ji. Sex- and age-related trajectories of the adult human gut microbiota shared across populations of different ethnicities. Nature Aging. 2021 January, pages87–100. doi.org/10.1038/s43587-020-00014-2.
9.Zhuye Jie, Suisha Liang, Qiuxia Ding, Fei Li, Shanmei Tang, Dan Wang, Yuxiang Lin, Peishan Chen,…,Weibin Liu, Huanming Yang, JianWang,Yong Hou, Xiao Liu, KarstenKristiansen, Huanzi Zhong, Huijue Jia,XunXu. A transomic cohort as a reference point for promoting a healthy human gut microbiome. Medicine in Microecology. 2021 August.
https://doi.org/10.1016/j.medmic.2021.100039.
10.Wangliping,Weisheng Lin, Xiaohong Li, Lijuan Zhang, Kai Wang, Xiaoli Cui, Shanmei Tang, Guangguang Fang, Yan Tan, Xuelai Wang, Chuan Chen, Chuanchun Yang, and Huiru Tang. A case report of congenital idiopathic hypogonadotropic hypogonadism caused by novel mutation of GNRHR gene. Medicine. 2021 Feb 5; 100(5): e24007. doi: 10.1097/MD.0000000000024007.
专利：
1.一种对特定菌种内的菌株进行定量分析的方法 彭也, 李俊桦, 唐珊媚, 张慧。
软著：
1.基于宏基因组数据构建和可视化泛基因组网络图的软件，简称“Pan Genome Network(PGN)”V1.0, 唐珊媚, 李俊桦；
2.原核微生物全基因组序列重复区域的移除软件，简称“Repeat_Remover”V1.0,李俊桦，林宇翔，唐珊媚；
3.遗传距离与地理距离相关性分析，简称“CAGGD(correlation analysis of genetic and geographic distance)”V1.0, 李晓云，赵海龙，李俊桦，唐珊媚；
4.基于单核苷酸突变对特定群中的亚群进行定量分析的软件，彭也，李俊桦，唐珊媚。
5.病原微生物基因检测及抗性基因注释软件，简称“PMG-detect”，唐珊媚
Google scholar 链接：https://scholar.google.com/citations?hl=en&user=i39hRD8AAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
