孙帅(sunshuai@genomics.cn),现任青岛华大基因研究院生物信息副研究员,主要从事于海洋生物基因组学与群体遗传学的研究。基于高通量DNA测序技术,对多种海洋生物进行了深入的基因组分析,揭示海洋生物的遗传多样性,以及挖掘、利用和保护基因资源。研究的物种涵盖了抹香鲸、南极磷虾、北象海豹、深海沟虾等多个物种,目前取得了多项科研成果。其中,于2023年在顶级期刊《细胞》(Cell)上发表了关于南极磷虾的基因组和群体研究成果,该研究首次在国际上解析了复杂基因组序列,获得了国内外专家的认可和媒体的报道。截至目前,已在Nature、Cell、Nature Genetics等国际SCI学术期刊上发表论文20余篇。
研究方向:动植物基因组学,动植物群体遗传学,海洋生物学
现任岗位:华大研究院 青岛分院 数字化地球研究所 专项科学家
教育背景:中国科学院大学 基因组学 博士
参与项目:
1.千种海洋生物基因组图谱绘制,2023/09-2026/08,参与
2.南海长棘海星灾害暴发机理、监测预警与防控技术研究(2022YFC3106301),2023/01-2026/12,参与
3.海洋生物多组学研究(内部项目),2022/08-2027/03,参与
4.南极磷虾、深渊钩虾等海洋生物基因组与群体遗传学
5.鹰嘴豆、毛竹等植物基因组与群体遗传学
论文:
1.Khan, A. W.#, Garg, V.#, Sun, S.#, Gupta, S., Dudchenko, O., Roorkiwal, M., Chitikineni, A., Bayer, P. E., Shi, C., Upadhyaya, H. D., Bohra, A., Bharadwaj, C., Mir, R. R., Baruch, K., Yang, B., Coyne, C. J., Bansal, K. C., Nguyen, H. T., Ronen, G., Aiden, E. L., …, Liu X.*, Edwards, D.*, Varshney, R. K.# (2024). Cicer super-pangenome provides insights into species evolution and agronomic trait loci for crop improvement in chickpea. Nature genetics, 56(6), 1225–1234. IF=31.7
2.Hoelzel, A. R., Gkafas, G. A., Kang, H., Sarigol, F., Le Boeuf, B., Costa, D. P., Beltran, R. S., Reiter, J., Robinson, P. W., McInerney, N., Seim, I., Sun, S.*, Fan, G.*, & Li, S.* (2024). Genomics of post-bottleneck recovery in the northern elephant seal. Nature ecology & evolution, 8(4), 686–694. IF=13.9
3.Shao, C.#*, Sun, S.#, Liu, K.#, Wang, J.#, Li, S.#, Liu, Q.#, Deagle, B. E., Seim, I., Biscontin, A., Wang, Q., Liu, X., Kawaguchi, S., Liu, Y., Jarman, S., Wang, Y., Wang, H. Y., Huang, G., Hu, J., Feng, B., De Pittà, C.*, … Fan, G*. (2023). The enormous repetitive Antarctic krill genome reveals environmental adaptations and population insights. Cell, 186(6), 1279–1294.e19. IF=45.5
4.Varshney, R. K., Roorkiwal, M., Sun, S., Bajaj, P., Chitikineni, A., Thudi, M., Singh, N. P., Du, X., Upadhyaya, H. D., Khan, A. W., Wang, Y., Garg, V., Fan, G., Cowling, W. A., Crossa, J., Gentzbittel, L., Voss-Fels, K. P., Valluri, V. K., Sinha, P., Singh, V. K., … Liu, X. (2021). A chickpea genetic variation map based on the sequencing of 3,366 genomes. Nature, 599(7886), 622–627. IF=50.5
5.Zhao, H.#, Sun, S.#, Ding, Y.#, Wang, Y.#, Yue, X., Du, X., Wei, Q., Fan, G., Sun, H., Lou, Y., Yang, H., Wang, J., Xu, X., Li, L., Yang, K., Xu, H., Wang, J., Zhu, C., Wang, S., Shan, X., …,Jiang Z.*, Gao, Z.* (2021). Analysis of 427 genomes reveals moso bamboo population structure and genetic basis of property traits. Nature communications, 12(1), 5466. IF=14.7
Research Gate 链接:https://www.researchgate.net/profile/Shuai-Sun-21
ORCID链接:https://orcid.org/0000-0003-1092-3186


