邱志旭（qiuzhixu@genomics.cn），西北农林科技大学生物信息学专业博士，复旦大学临床医学博士后，现为华大基因股份有限公司智惠医学研究院专项科学家。目前从事青光眼遗传学研究和孕期疾病cfDNA预测算法开发工作。目前发表文章7篇，公司内部在研项目2个。
研究方向：
1.青光眼中国人群遗传机制研究 青光眼是全球首位不可逆致盲性眼病，40岁-80岁人群青光眼发病率为3.54%，随着老龄化的加深青光眼防控工作日益严峻。青光眼受遗传因素影响较大，其早期无明显症状，目前临床缺少有效的筛查手段。针对这一问题，课题组与复旦大学附属眼耳鼻喉科医院合作，建立青光眼队列，开展基于基因组、影像等多模态数据构建青光眼风险预测模型的研究，推动青光眼早筛早诊早治疗。
2.基于cfDNA的孕期疾病早期预测的探索研究 cfDNA在无创产前基因检测（NIPT）发挥了巨大的作用，极大地减少了出生缺陷的发生。越来越多研究的表明cfDNA除了做基因检测，其蕴含片段组学特征和甲基化修饰等表观组学特征在复杂疾病预测方面存在巨大潜力。为了进一步挖掘NIPT数据在预测复杂疾病的价值，课题组借助河北省百万级NIPT数据库建设积累样本资源，拟探索基于cfDNA多模态特征构建预测子痫前期、早产等复杂孕期疾病模型。
现任岗位：华大股份 智惠医学研究院 专项科学家
教育背景：西北农林科技大学 生物信息学 博士
参与项目：
1.青光眼遗传学研究，在研，公司内部研发项目（300W以上），生物信息学分析负责人
2.心肌病基因组学研究，在研，公司内部研发项目（300W以上），生物信息学分析负责人
论文：
1.Li, T., Ma, Y., Cheng, Y., Zhao, Y., Qiu, Z., Liu, H., ... & Wu, J. (2024). Single-Cell Transcriptomic Dataset of RPGR-associated Retinitis Pigmentosa Patient-Derived Retinal Organoids. Scientific Data, 11(1), 1285.
2.Wang, Q., Jiang, S., Li, T., Qiu, Z., Yan, J., Fu, R., ... & Cheng, Q*. (2023). G2P Provides an Integrative Environment for Multi-model genomic selection analysis to improve genotype-to-phenotype prediction. Frontiers in Plant Science, 14, 1207139.
3.Qiu, Z#., Chen, S#., Qi, Y., Liu, C., Zhai, J., Xie, S., & Ma, C*. (2020). Exploring transcriptional switches from pairwise, temporal and population RNA-Seq data using deepTS. Briefings in Bioinformatics, bbaa137.
4.Ma, W#., Qiu, Z#., Song, J., Li, J., Cheng, Q., Zhai, J., & Ma, C*. (2018). A deep convolutional neural network approach for predicting phenotypes from genotypes. Planta, 248(5), 1307-1318.
ORCID链接：https://orcid.org/0000-0003-1979-5272
