邓子卿（dengziqing@genomics.cn），研究员，北京华大生命科学研究院/北京华大生物与信息融合技术研究院院长，博士研究生学历。中国科学院大学研究生导师，清华大学行健书院校外导师，深圳市海外高层次人才。主要从事微生物及组学技术研究，包括新发突发传染病、感染免疫、细菌耐药、环境微生物组等。在Nature Biotech等国际期刊发表论文20余篇。深圳市未知病原体应急检测重点实验室副主任，国家重点研发计划“前沿生物技术”重点专项专家组成员，hLife青年编委会委员，中国海洋工程咨询协会海洋生态环境监测分会第二届理事会理事。曾获“全国科技系统抗击新冠肺炎疫情先进个人”表彰。
研究方向：
1.新发突发传染病：病原监测、病原风险评估和潜在威胁人类病原体识别，基于海量测序数据构建全球病原数据平台，结合人工智能解析病原宿主谱及分布热点，建立自然疫源疫病监测预警体系。
2.临床病原组学：临床耐药病原菌比较基因组学，临床感染大数据转化应用研究，基于全基因组和宏基因组技术对临床感染组学数据进行挖掘和解读，并开发基于高精度测序平台的病原相关检测技术，为临床快速病原体检测提供基础。
3.感染时空组学：应用单细胞组学、空间组学等前沿组学技术，开发应用于传染病研究的多组学实验技术和算法，揭示病原微生物与宿主互作的免疫分子机制。
现任岗位：华大研究院 北京分院 院长
教育背景：香港大学 微生物学 博士
参与项目：
1.国家重点研发计划，病原学与防疫技术体系研究重点专项，潜在威胁人类病原体发现与挖掘，2021/12-2024/12，主持，课题负责人
2.国家自然科学基金，青年科学基金，肠道菌耐药表型及其耐药机制的全基因组关联分析，2023/1-2025/12，主持，项目负责人
3.国家重点研发计划，合成生物学重点专项，水华蓝藻合成微生物控制系统构建与应用，2019/7-2024/6，参加，课题骨干
4.国家重点研发计划重点专项，生物安全关键技术重点专项，生物安全相关核心计量技术和标准物质研究，2018/8-2021/6，参加
论文:
1.Han, Xiaofeng, et al. Effects of erythromycin on biofilm formation and resistance mutation of Escherichia coli on pristine and UV-aged polystyrene microplastics. Water Research 256(2024).
2.Hu, Ming, et al. Characterization of a novel genus of jumbo phages and their application in wastewater treatment. iScience 26.6 (2023).
3.Yang, Lili, et al. Global transmission of broad-host-range plasmids derived from the human gut microbiome. Nucleic Acids Research 51, 8005-8019 (2023).
4.Song, Minfang, et al. Characterization of the evolution trajectory and immune profiling of new histologic patterns in lung adenocarcinoma. The Journal of Gene Medicine 24, e3455 (2022).
5.Du, K. et al. Comparative genomic analysis of five freshwater cyanophages and reference-guided metagenomic data mining. Microbiome 10, 128 (2022).
6.Cheng, L. et al. Harnessing stepping-stone hosts to engineer, select, and reboot synthetic bacteriophages in one pot. Cell Reports Methods 2(2022).
7.Wang, D., Ning, Q., Deng, Z., Zhang, M. & You, J. Role of environmental stresses in elevating resistance mutations in bacteria: Phenomena and mechanisms. Environmental Pollution 307, 119603 (2022).
8.Zhao, H. et al. Global Landscape of Clostridioides Difficile Phylogeography, Antibiotic Susceptibility, and Toxin Polymorphisms by Post-Hoc Whole-Genome Sequencing from the MODIFY I/II Studies. Infectious Diseases and Therapy 10, 853-870 (2021).
9.Zou, Y. et al. 1,520 reference genomes from cultivated human gut bacteria enable functional microbiome analyses. Nature Biotechnology 37, 179-185 (2019).
10.Song, W. et al. Prophage Hunter: an integrative hunting tool for active prophages. Nucleic Acids Research 47, W74-W80 (2019).
Google scholar 链接：https://scholar.google.com/citations?user=54Wlm9sAAAAJ&hl=en
Orcid链接：https://orcid.org/0000-0001-8726-0160
