张艳（zhangyan15@genomics.cn），基因组学副研究员，清华大学博士，从事分子生物学和基因组学研究。主要研究方向为“液体活检”，研究人体血液样本的多组学特征，挖掘新型的疾病标志物。带领团队开发游离核酸检测新技术（DNA技术：环状、单链、甲基化、片段化特征；RNA技术），解决样本制备和测序分析的相关问题，研发血液多组学组织溯源和器官评估新技术，参与CKB项目（中国慢性病前瞻性研究，50万人大型自然人群队列），致力于推动血液多组学技术在人群健康评估和慢病防治领域的临床转化应用。
作为研究生导师，已指导5名硕士研究生完成学业。目前团队成员共9名，包括中国科学院大学联合培养的博士生2名，华南理工大学等联合培养的硕士生3名，以及实验技术骨干1名和生信技术骨干2名。
担任深圳市数字化细胞病理概念验证中心骨干成员，已主持完成国家自然科学基金青年基金项目1项，参与国家重点研发计划1项，曾参与国家重点基础研究发展计划（973计划）1项、深圳市科创委项目2项。曾受邀担任国家自然科学基金通讯评议专家，Frontiers in Microbiology杂志论文审稿人。曾在Microbiome、Nature Communications、Biotechnology advances、GigaScience、BMC Bioinformatics、Clinica Chimica Acta等学术杂志发表SCI论文31篇，其中一作或通讯作者论文8篇；已申请发明专利8项（PCT专利2项），其中已获授权3项。
研究方向：液体活检，血液多组学，器官与衰老评估
现任岗位：华大研究院 粤港澳分院 精准健康研究所 生物技术副研究员
教育背景：清华大学 化学工程与技术专业（生物化工） 博士
参与项目：
1.重大病毒病的易感性机制及筛查关键技术研究，国家重点研发计划
2.新冠患者血浆游离DNA特征解析及其产生机制研究，国家自然科学基金
3.中国慢性病前瞻性研究 China Kadoorie Biobank
4.探究细胞免疫治疗及造血干细胞移植治疗后组织损伤的血浆游离DNA标志物，深圳市协同创新科技计划
5.利用多组学技术研究高海拔环境下人体的应激反应（珠峰行动）
6.成年人群外周血免疫细胞多样性与遗传机制研究
7.重性抑郁障碍与双相障碍患者的PBMC和血浆cfRNA研究
论文:
1.Hu, X. T.#, H. Q. Zhang#, Y. Q. Wang#, Y. Lin#, Q. Y. Li, L. G. Li, G. D. Zeng, R. J. Ou, X. Y. Cheng, Y. Zhang* and X. Jin* (2024). "Effects of blood-processing protocols on cell-free DNA fragmentomics in plasma: Comparisons of one- and two-step centrifugations." Clinica Chimica Acta 560.
2.Hu, Y., Y. Zhao*, Y. Zhang, W. Chen, H. Zhang* and X. Jin* (2024). "Cell-free DNA: a promising biomarker in infectious diseases." Trends Microbiol.
3.Zhang, H.#, L. Li#, Y. Luo#, F. Zheng#, Y. Zhang#, R. Xie#, R. Ou, Y. Chen, Y. Lin, Y. Wang, Y. Jin, J. Xu, Y. Tao, R. Qu, W. Zhou, Y. Bai, F. Cheng* and X. Jin* (2024). "Fragmentomics of plasma mitochondrial and nuclear DNA inform prognosis in COVID-19 patients with critical symptoms." BMC Med Genomics 17(1): 243.
4.Luo, Y.#, H. Zhang#, L. Li, Y. Lin, X. Wang, W. Chen, Y. Tao, R. Ou, W. Zhou, F. Zheng, Y. Jin, F. Cheng, H. Zhu, Y. Zhang* and X. Jin* (2024). "Heat inactivation does not alter host plasma cell-free DNA characteristics in infectious disease research." Clin Chim Acta 553: 117751.
5.Peng, T.,# H. Zhang#, L. Li#, C. Cao#, M. Xu, X. Liu, S. Lin, P. Wu, T. Chu, B. Liu, Y. Xu, Y. Zhang, Y. Wang, J. Yu*, W. Ding*, X. Jin* and P. Wu* (2024). "Plasma Cell-Free DNA Concentration and Fragmentomes Predict Neoadjuvant Chemotherapy Response in Cervical Cancer Patients." Adv Sci 11(43): e2309422.
6.Bai, Y.#, F. Zheng#, T. Zhang#, Q. Luo, Y. Luo, R. Zhou, Y. Jin, Y. Shan, J. Cheng, Z. Yang, L. Li, H. Zhang, Y. Zhang, J. Yin, M. Fang, D. Chen, F. Cheng* and X. Jin* (2022). "Integrating plasma cell-free DNA with clinical laboratory results enhances the prediction of critically ill patients with COVID-19 at hospital admission." Clin Transl Med 12(7): e966.
7.Wang, S.#, H. Wang#, F. Jiang#, A. Wang, H. Liu, H. Zhao, B. Yang, D. Xu, Y. Zhang* and W. Fan* (2022). "EndHiC: assemble large contigs into chromosome-level scaffolds using the Hi-C links from contig ends." BMC Bioinformatics 23(1): 528.
8.Zhang, Y.#, F. Jiang#, B. Yang#, S. Wang, H. Wang, A. Wang, D. Xu and W. Fan* (2022). "Improved microbial genomes and gene catalog of the chicken gut from metagenomic sequencing of high-fidelity long reads." Gigascience 11.
9.Huang, P.#, Y. Zhang#, K. P. Xiao#, F. Jiang#, H. C. Wang, D. Z. Tang, D. Liu, B. Liu, Y. S. Liu, X. He, H. Liu, X. B. Liu, Z. X. Qing, C. H. Liu, J. L. Huang, Y. W. Ren, L. Yun, L. J. Yin, Q. Lin, C. Zeng, X. G. Su, J. Y. Yuan, L. Lin, N. X. Hu, H. L. Cao, S. W. Huang, Y. M. Guo*, W. Fan* and J. G. Zeng* (2018). "The chicken gut metagenome and the modulatory effects of plant-derived benzylisoquinoline alkaloids." Microbiome 6.
10.Liu, C.#, Y. Zhang#, Y. Ren#, H. Wang, S. Li, F. Jiang, L. Yin, X. Qiao, G. Zhang, W. Qian, B. Liu* and W. Fan* (2018). "The genome of the golden apple snail Pomacea canaliculata provides insight into stress tolerance and invasive adaptation." Gigascience 7(9).
Google scholar 链接：https://orcid.org/0000-0003-2281-7807
