陈亮(chenliang8@genomics.cn),博士,杭州华大生命科学研究院研究员/博导、细胞组学技术中心主任科学家、院管理团队成员、杭高院兼职导师,学科专业为分子生物学与生物化学/基因组学/生物信息学,研究兴趣为RNA生物学、新一代组学技术研发、发育与肿瘤机理。本科硕士毕业于浙江大学,博士毕业于美国辛辛那提大学医学院,曾任美国加州大学圣地亚哥分校博士后研究员,武汉大学生命科学学院研究员,长聘教授,湖北省“百人”计划获得者。研究方向包括新一代单细胞/空间组长读长测序、靶向技术开发与应用,以及发育/再生与肿瘤发生机制研究。研究工作以通讯/第一作者发表在Science、Molecular Cell、Nature Protocols、Science Advances等国际权威学术期刊,总发表论文近50篇。成果被Science、Nature Review Genetics、Nature Methods、Cancer Discovery等特约评论。主持/参与多项基金委/科技部,浙江省“尖兵”和杭州市重点科研项目。
研究方向:RNA生物学、功能基因组学、转录调控
现任岗位:华大研究院 杭州分院 主任科学家
教育背景:美国辛辛那提大学医学院 分子毒理 博士
参与项目:
1.作为主要负责人绘制首个脑再生时空图谱,成果以封面文章发表在《科学》期刊,入选“中国生命科学十大进展”、“浙江省十大科技事件”,被《科学》《自然综述-遗传学》亮点评述;
2.主导与参与开发多种基因组结构与转录调控的检测技术,被领域广泛采用,成果以封面文章发表在《分子-细胞》《自然-生物技术》等期刊,被《自然综述-遗传学》、《自然-方法》亮点评述;
3.首次报道RNA加工因子突变在白血病中的致病机制,研究成果促进新靶向药物临床实验,成果发表在《分子-细胞》《英国癌症杂志》等期刊,被《癌症探索》等亮点评述。
论文:
1.Wei, X., Fu, S., Li, H., Liu, Y., Wang, S., Feng, W., Yang, Y., …, Liu, L., Chen, L.*, Xu, X.*, Fei, J-F.*, Gu Y.*. Single-cell Stereo-seq reveals induced progenitor cells involved in axolotl brain regeneration. Science, 2022, 377, eabp9444. Cover Story and highlighted by Science and Nat Rev Genet.
2.Wang, X., Sun, Q., Liu, T., Lu, H., Lin, X., Wang, W., Liu, Y., Huang, Y., Huang, G., Sun, H., Chen, Q., Wang, J., Tian, D., Yuan, F., Liu, L., Wang, B., Gu, Y., Liu, B., Chen. L. Single-cell multi-omics sequencing uncovers region-specific plasticity of glioblastoma for complementary therapeutic targeting. Sci Adv, 2024, 47, eadn4306.
3.Zhang, X. #, Liang, S-B. #, Yi, Z. #, Qiao, Z., Xu, B., Geng, H., Wang, H., Yin, X., Tang, M., Ge, W., Xu, Y-Z., Liang, K., Fan, Y-J. *, Chen. L. * Global coupling of R-loop dynamics with RNA polymerase II modulates gene expression and early development of Drosophila. Nucleic Acids Res, 2024, 52, 13110-13127.
4.Liang, F., Jin, J., Li, Q., Duan, J., Jiang, Ao., Chen, X., Geng, H., Wu, K., Yu, F., Zhao, X., Zhou, Y., Hu, D.*, Liang Chen*. DOT1L/H3K79me2 Represses HIV-1 Reactivation via Recruiting DCAF1. Cell Rep, 2024, 43, 114368.
5.Zhang, F.#; Sun, J.#; Zhang, L.; Li, R.; Wang, Y.; Geng, H.; Shen, C.; Li, L.*; Chen, L.* PARP inhibition leads to synthetic lethality with key splicing-factor mutations in myelodysplastic syndromes. Br J Cancer, 2024, 131, 231-242.
6.Wang, X., Sun, Q., Wang, W., Liu, B.*, Gu, Y.*, Chen, L.*. Decoding key cell subpopulations and molecular alterations in glioblastoma at recurrence by single-cell analysis.Acta Neuropathol Commun, 2023, 11, 125.
7.Wei, X.#, Li, H.#, Du, J., Zeng, X., Xu, X.*, Chen, L.*, Gu Y.*. Re-exploring tissue regeneration by novel spatial transcriptomics technologies. Clin Transl Med, 2022, 12,e1127.
8.Zhang, F., and Chen, L.* Molecular Threat of Splicing Factor Mutations to Myeloid Malignancies and Potential Therapeutic Modulations. Biomedicines, 2022, 10, 1972.
9.Xu, B., Zhang, C., Jiang, A.,… Zhou, Y., Chen, L.*, Sun, H*. Histone methyltransferase Dot1L recruits O-GlcNAc transferase to target chromatin sites to regulate histone OGlcNAcylation. JBC, 2022, 298, 102115.
10.Lin, R., Zhong, X., Zhou, Y., Geng, H., Hu, Q., Huang, Z., Hu, J., Fu, X-D., Chen, L.*, Chen,J-Y*. R-loopBase: a knowledgebase for genome-wide R-loop formation and regulation. NAR,2022, D303-D315


