殷鹏(yinpeng@genomics.cn),博士,中国科学院大学博士生导师,深圳市高层次人才(海外)。研究方向为计算生物学,多模态AI大模型,在国际著名期刊Advanced Science、Lancet Respiratory Medicine和一流国际会议发表文章几十余篇,并多次获优秀论文奖;申请国内发明专利20余项,PCT专利3项,授权发明专利6项。中国科学技术大学统计学本科,英国纽卡斯尔大学统计学博士,利物浦大学统计遗传学博士后。完成国家自然科学基金1项,承担科技部重点研发、中科院重点项目(先导B、STS)子课题,深圳市科创委重点项目4项。中国医促会健康大数据和数字化医疗分会青年委员,中国计算机学会、中国生物工程协会、深圳市人工智能协会会员等。
研究方向:计算生物学,多模态AI大模型
现任岗位:华大研究院 智能所 AI算法负责人
教育背景:英国纽卡斯尔大学 统计学 博士
参与项目:
1.深圳市科技创新委员会,基础研究专项(自然科学基金)重点项目,JCYJ20220818101216035,基于多组学技术的疾病诊断算法研究,2023-02至今,150万元,在研,主持
2.中国科学院,B类战略性先导科技专项,XDB38040000,多维大数据驱动的中国人群精准健康研究,数据挖掘、计算与分析系统,2020-01至今,1700万元,在研,参与
3.国家自然科学基金委员会,青年基金项目,11801542,基于偏差估计的协变量不可忽略缺失数据敏感性分析研究, 2019-01至2021-12,26万元,结题,主持
论文:
1.Hu, Fan; Hu, Yishen; Zhang, Weihong; Huang, Huazhen; Pan, Yi; Yin, Peng* ; A Multimodal Protein Representation Framework for Quantifying Transferability Across Biochemical Downstream Tasks, Advanced Science, 2023
2.F. Hu; W. Zhang; H. Huang; W. Li; Y. Li; P. Yin* ; A Transferability-Based Method for Evaluating the Protein Representation Learning, IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics, 2024, 1-9
3.Fan Hu#; Lei Wang#; Yishen Hu; Dongqi Wang; Jianbin Jiang; Nan Li*; Peng Yin* ; A Novel Framework Integrating AI Model and Enzymological Experiments Promotes Identification of SARS-CoV- 2 3CL Protease Inhibitors and Activity-based Probe., Briefings in bioinformatics, 2021, bbab301:1-13
4.Hu, Fan; Wang, Dongqi; Huang, Huazhen; Hu, Yishen; Yin, Peng* ; Bridging the Gap betweenTarget-Based and Cell-Based Drug Discovery with a Graph Generative Multitask Model, Journal of Chemical Information and Modeling, 2022, 62(23): 6046-6056
5.Zhu, Muchun#; Yin, Peng#*; Hu, Fan; Jiang, Jiaxin; Yin Li; Li Yingxiang; Wang Shuqiang ; Integrating genome-wide association and transcriptome prediction model identifies novel target genes for osteoporosis, Osteoporosis International, 2021, 32(12): 2493-2503
6.Turner, Richard M.*; Fontana, Vanessa; Zhang, Jieying E.; Carr, Daniel; Yin, Peng; FitzGerald, Richard; Morris, Andrew P.; Pirmohamed, Munir ; A Genome-wide Association Study of Circulating Levels of Atorvastatin and Its Major Metabolites, Clinical Pharmacology & Therapeutics, 2020, 108(2): 287-297
7.Fan Hu; Jiaxin Jiang; Peng Yin* ; Prediction of Potential Commercially Available Inhibitors against SARS-CoV-2 by Multi-Task Deep Learning Model, Biomolecules, 2022, 12(8): 0-1156
8.Hu, Fan; Jiang, Jiaxin; Wang, Dongqi; Zhu, Muchun; Yin, Peng* ; Multi-PLI: interpretable multi-task deep learning model for unifying protein-ligand interaction datasets, Journal of Cheminformatics, 2021, 13(1): 30
专利:
1.一种基于深度学习模型的基因序列预测方法及相关设备,发明专利,2022,第2作者,专利号: CN202211536008.0
2.药物筛选方法及系统,发明专利,2022,第2作者,专利号:CN115132270A
3.特发性肺纤维化中罕见巨噬细胞亚群及疾病标志物的鉴定方法及系统,发明专利,2022,第3作者,专利号: CN114708918A
4.基于混合实验组和对照组单细胞样本的差异分析方法及系统,发明专利,2022,第2作者,专利号: CN114864003A
5.一种基于多任务深度学习模型预测化合物性质的方法,发明专利,2022,第2作者,专利号:CN114566230A
6.一种模型预测的关键区域的分析方法及装置,发明专利,2020,第3作者,专利号:CN111161789A
7.基因型数据缺失的填充方法、装置及服务器,发明专利,2020,第2作者,专利号:CN111028884A
8.基因型数据缺失的填充方法、装置及服务器,2023,第2作者,专利号:CN111028884B
9.一种分子间的结合活性预测方法及装置,发明专利,2020,第3作者,专利号:CN110910964A
10.一种小分子抑制剂在抑制病毒沉默抑制蛋白中的应用,发明专利,2020,第5作者,专利号:CN111329858A


