孙海汐（sunhaixi@genomics.cn），博士。2017 年 9 月加入深圳华大生命科学研究院并入选“深圳市海外高层次人才”和“深圳市盐田区高层次人才”。研究方向为生物信息学，基础研究和企业研发经历丰富，与华大内部各方向、外部高校等科研机构开展生物信息学合作，通过多组学大数据的解析促进各类生物学问题的新发现。曾获得2022年度深圳华大生命科学研究院“优秀导师”，2021年深圳华大生命科学研究院“提名奖”，华大集团2020年度杰出贡献内训师，2019年度深圳华大生命科学研究院“技术牛人”等奖项。
研究方向：生物信息学
现任岗位：华大研究院 数字化地球研究所 主任科学家
教育背景：中国科学院大学 生物信息学 博士
参与项目：
1.双生病毒感染植物时空组
2.血液疾病相关的组学机理研究和调控序列挖掘
3.物种嵌合发育
论文:
1.Dehydration stress extends mRNA 3' untranslated regions with noncoding RNA functions in Arabidopsis
2.Bioinformatics approaches to studying plant long noncoding RNAs (lncRNAs): identification and functional interpretation of lncRNAs from RNA-Seq data sets
3.A comprehensive survey of genomic mutations in breast cancer reveals recurrent neoantigens as potential therapeutic targets
4.A novel computational method enables RNA editome profiling during human hematopoiesis from scRNA-seq data
5.The Single-cell Stereo-seq reveals region-specific cell subtypes and transcriptome profiling in Arabidopsis leaves
6.Prophage Hunter: an integrative hunting tool for active prophages
7.ELF18-INDUCED LONG NONCODING RNA associates with Mediator to enhance expression of innate immune response genes in Arabidopsis
8.Combining metabolomics and transcriptomics to characterize tanshinone biosynthesis in Salvia miltiorrhiza
9.Derivation of Intermediate Pluripotent Stem Cells Amenable to Primordial Germ Cell Specification
10.Plasma cell-free RNA characteristics in COVID-19 patients
专利：
1.一种mRNA 5' 3'末端差异的快速检测方法
2.检测慢病毒插入位点的测序文库构建方法和慢病毒插入位点检测方法
3.一种基于细菌全基因组数据挖掘温和型噬菌体的方法
4.用于动物胚胎解离的试剂盒和方法
5.基于NGS技术的无菌检测方法
软著：
1.Non-coding Transcriptome Analysis Toolkit software
2.Single-cell traversal clustering analysis软件
3.鉴定细胞类型RNA编辑软件
