成梦南(chengmengnan@genomics.cn),理学博士,毕业于中国科学院大学,华大生命科学研究院超级细胞所生物信息副研究员。研究方向为多组学技术研发和应用,包括空间组学技术开发、单细胞高通量技术开发,以及应用前沿组学技术解析模式生物胚胎发育过程中的细胞命运决定机制。近年来在《Cell》,《Nature》,《Science》,《Nature Communications》等杂志发表论文15篇,其中第一作者(含共同一作)5篇,申请发明专利1项。课题组延续性的聚焦于前沿组学技术开发和应用,包括基于现有的空间组技术,开发3D空间组、靶向空间组、空间细胞通讯检测、空间多组学等技术,并将其应用在胚胎发育和脑科学研究中。项目组目前进行的技术研发类项目3项,应用文章1项。
研究方向:细胞组学技术研发和应用
现任岗位:华大生命科学研究院 超级细胞研究所 生物信息副研究员
教育背景:中国科学院大学 基因组学 博士
参与项目:
1.曾作为核心人员参与并推动亚细胞精度的时空组学技术Stereo-seq的技术研发,实现了自主技术从0到1的突破。该项目创新性的将国产测序芯片与细胞组学技术相结合,实现了纳米级空间分辨率、厘米级大视场的时空转录组学新技术,为相关生命科学基础研究提供了强大的自主工具。
2.利用该技术,作为主要负责人构建了首个高精度小鼠胚胎发育时空图谱,解析了发育空间细胞和分子的动态变化过程。该研究入选了“2022年中国十大科技成果”和“2022年中国生物信息学十大进展”,本研究工作以封面故事发表于《Cell》。
3.作为主要负责人,利用自主研发的时空组学技术和单细胞多组学测序技术,绘制了猕猴大脑皮层多组学细胞图谱,探究了前额皮层、初级视觉皮层和初级运动皮层的细胞异质性,解析了非人灵长类动物大脑皮层不同区域兴奋性神经元的基因表达模式。
论文:
1.Chen A*, Liao S*, Cheng M*, Ma K*, Wu L*, et al. Spatiotemporal transcriptomic atlas of mouse organogenesis using DNA nanoball patterned arrays[J]. Cell, 2022, 185, 1–16. (IF: 41.582)
2.Lei Y*, Cheng M*, Li Z*, Zhuang Z*, Wu L*, et al. Spatially resolved gene regulatory and disease-related vulnerability map of the adult Macaque cortex[J]. Nature communications, 2022, 13:6747. (IF: 14.919)
3.Cheng M*, Jiang Y*, Xu J, et al. Spatially resolved transcriptomics: a comprehensive review of their technological advances, applications, and challenges[J]. Journal of Genetics and Genomics, 2023.03.011 (IF: 5.723)
4.Cheng M*, Wu L*, Han L, et al. A cellular resolution spatial transcriptomic landscape of the medial structures in postnatal mouse brain[J]. Frontiers in Cell and Developmental Biology. 2022, 10:878346 (IF: 6.684)
5.Han X*, Cheng M*, ..., et al. 7,8-Dihydroxyflavone protects PC12 cells against 6-hydroxydopamine-induced cell death through modulating PI3K/Akt and JNK pathways[J]. Neuroscience Letters, 2014 (IF: 3.197)
6.Wu L*, Yan J*, Bai Y*, Chen F*, Zou X*, Xu J*, …, Cheng M, et, al. An invasive zone in human liver cancer identified by Stereo-seq promotes hepatocyte–tumor cell crosstalk, local immunosuppression and tumor progression[J]. Cell Research, (2023) 0:1–19. (IF: 46.351)
7.Wei X*, Fu S*, Li H*, …, Cheng M, et al. Single-cell Stereo-seq reveals induced progenitor cells involved in axolotl brain regeneration[J]. Science. 377, eabp9444 (2022). (IF: 47.728)
8.Han L*, Wei X*, Liu C*, ..., Cheng M, et al. Single-cell transcriptomic atlas of the adult non-human primate Macaca fascicularis[J]. Nature, 2022, 604, 723–731. (IF: 49.962)
9.Ou Z*, Lin S*, Qiu J*, …, Cheng M, et al. Single-Nucleus RNA Sequencing and Spatial Transcriptomics Reveal the Immunological Microenvironment of Cervical Squamous Cell Carcinoma[J]. Advanced Science. 202203040. (IF: 15.444)
10.Wang M*, Hu Q*, Lv T*, ..., Cheng M, et al. High-resolution 3D spatiotemporal transcriptomic maps of developing Drosophila embryos and larvae[J]. Developmental Cell, 2022, 57, 1–13. (IF: 12.270)


