赵海龙（zhaohailong@genomics.cn）丹麦哥本哈根大学分子生物医学博士，副高级研究员，深圳市未知病原体应急检测重点实验室骨干成员，中国科学院大学华大教育中心研究生导师，援非培训导师。2014年加入华大生命科学研究院，长期从事病原微生物组学研究，主持国自然科学基金项目1项，作为核心骨干参与10多项国家级科技项目。累计在Nature Ecology & Evolution，Microbiome，Science，Nature biotechnology等杂志发表SCI论文10余篇，发明专利2项，软件著作权5项。与多国科研人员合作，基于宏转录组，长读长测序数据对全球虫媒，野生动物等所携带的细菌真菌，病毒及寄生虫等进行深入挖掘，揭示病原感染，演化，预测预警传播趋势，为传染病的防控提供理论、数据和技术支撑。
研究方向：病原感染多组学
现任岗位：华大研究院 精准健康研究所 生物信息副研究员
教育背景：哥本哈根大学 分子生物医学 博士
参与项目:
1. 国自然青年《宏转录组学结合AI生物大模型解析白纹伊蚊多组织微生态互作及其环境驱动因素》，30万，主持，在研
2. 国家重点研发计划《合成微生物技术在蚊媒疾病防控中的风险评估与应对策略》，300万，骨干，在研
3. 国家重点研发计划《潜在威胁人类病原体发现与挖掘-可移动实验体系与病原大数据资源平台研发》，570万，骨干，结题
4. 国家科技重大专项《病原体分子演化和持续传播风险评估技术研究》，320万，参与，在研
5. 国家重点研发计划《亚非重要呼吸道病毒跨种传播与跨境扩散风险研究》，100万，参与，在研
6. 广州国家实验室《我国及东南亚邻国自然疫源动物病毒组调查》，325万，参与，在研
7. 盖茨基金会《塞拉利昂疟疾分子实验室流行病学网络能力建设试点项目》，225万，参与，在研
8. 崖州湾科技城《海南重要经济作物病害病原物基因组共享数据库构建及应用》，363万，骨干，在研
论文:
1. Pan YF#， Zhao H#， Gou QY#， Shi PB， Tian JH， Feng Y， Li K， Yang WH， Wu D， Tang G， Zhang B， Ren Z， Peng S， Luo GY， Le SJ， Xin GY， Wang J， Hou X， Peng MW， Kong JB， Chen XX， Yang CH， Mei SQ， Liao YQ， Cheng JX， Wang J， Chaolemen， Wu YH， Wang JB， An T， Huang X， Eden JS， Li J， Guo D， Liang G， Jin X， Holmes EC， Li B， Wang D， Li J， Wu WC， Shi M. Metagenomic analysis of individual mosquito viromes reveals the geographical patterns and drivers of viral diversity[J]. Nature Ecology & Evolution， 2024.（共一）
2. Wang D#， Yang X#， Ren Z#， Hu B#， Zhao H#， Yang K， Shi P， Zhang Z， Feng Q， Nawenja CV， Obanda V， Robert K， Nalikka B， Waruhiu CN， Ochola GO， Onyuok SO， Ochieng H， Li B， Zhu Y， Si H， Yin J， Kristiansen K， Jin X， Xu X， Xiao M， Agwanda B， Ommeh S， Li J， Shi ZL. Substantial viral diversity in bats and rodents from East Africa： insights into evolution， recombination， and cocirculation[J]. Microbiome， 2024. （共一）
3. Zhang L， Wang D， Shi P， Li J， Niu J， Chen J， Wang G， Wu L， Chen L， Yang Z， Li S， Meng J， Ruan F， He Y， Zhao H， Ren Z， Wang Y， Liu Y， Shi X， Wang Y， Liu Q， Li J， Wang P， Wang J， Zhu Y， Cheng G. A naturally isolated symbiotic bacterium suppresses flavivirus transmission by Aedes mosquitoes[J]. Science， 2024.
4. Xin G， Wang D， Zhang X， Ren Z， Zhao H， Shi P， Mi X， Jin X， Deng Z， Li J， Chen J. Infectome analysis of small mammals in Southern China reveals pathogen ecology and emerging risks[J]. Nature Communications， 2025.
5. Wang D， Li L， Ren Z， Yu Y， Zhang Z， Zhou J， Zhao H， Zhao Z， Shi P， Mi X， Jin X， Deng Z， Li J， Chen J. Host specificity and geographic dispersion shape virome diversity in Rhinolophus bats[J]. Molecular Ecology， 2024.
6. Peng MW， Wu YH， Ren Z， Narigen， Hou RS， Xin GY， Liao YQ， Wang J， Le SJ， Shi PB， Zhao H， Deng Z， Jin X， Xiao M， Chaolemen， Li J， Shi M， Wang D. Meta-transcriptomics characterization of individual Marmota sibirica reveals a wide spectrum of viral and bacterial pathogens in Inner Mongolia of China[J]. Microbiology Spectrum， 2025.
7. Zhao H， Nickle DC， Zeng Z， Law PYT， Wilcox MH， Chen L， Ye P， Meng J， Deng Z， Albright A， Zhong H， Xu X， Zhu S， Shen J， Blanchard RL， Dorr MB， Shaw PM， Li J. Global Landscape of Clostridioides Difficile Phylogeography， Antibiotic Susceptibility， and Toxin Polymorphisms by Post-Hoc Whole-Genome Sequencing from the MODIFY I/II Studies[J]. Infectious Diseases and Therapy， 2021.
8. Zeng Z#， Zhao H#， Dorr MB， Shen J， Wilcox MH， Poxton IR， Guris D， Li J， Shaw PM. Bezlotoxumab for prevention of Clostridium difficile infection recurrence： Distinguishing relapse from reinfection with whole genome sequencing[J]. Anaerobe， 2020. （共一）
9. Li J， Jia H， Cai X， Zhong H， Feng Q， Sunagawa S， Arumugam M， Kultima JR， Prifti E， Nielsen T， Juncker AS， Manichanh C， Chen B， Zhang W， Levenez F， Wang J， Xu X， Xiao L， Liang S， Zhang D， Zhang Z， Chen W， Zhao H， Al-Aama JY， Edris S， Yang H， Wang J， Hansen T， Nielsen HB， Brunak S， Kristiansen K， Guarner F， Pedersen O， Doré J， Ehrlich SD， Bork P， Wang J. An integrated catalog of reference genes in the human gut microbiome[J]. Nature Biotechnology， 2014.
专利
1. 李俊桦；赵海龙；彭也；Peter·M·Shaw；David·Nickle；沈具东；艰难梭菌耐药/低敏感进化分支SNP 标记及菌株类别鉴定方法和应用，授权公告号:CN112481395B （授权）
2. 李俊桦；赵海龙；彭也；Peter·M·Shaw；David·Nickle；沈具东；SNP MARKERS OF DRUG REDUCED SUSCEPTIBILITY RELATED EVOLUTIONARY BRANCHES OF CLOSTRIDIUM DIFFICILE, METHOD FOR IDENTIFYING STRAIN CATEGORY, AND USE THEREOF，2019.06.24，申请号：PCT/CN2019/092585.
软件著作权
1. 尚于翠，粱天柱，赵海龙，裴娜；细菌全基因组长短读长混合组装软件，C1-2022-111，2022-11-16
2. 孙婉莹；赵海龙；裴娜；细菌群体并行分析软件，2018SR1018887， 2018-8-16.
3. 李晓云；赵海龙；李俊桦；唐珊媚；遗传距离与地理距离相关性分析，2017SR061637，原始取得，全部权利，2017-2-28.
4. 赵海龙；李芳；李晓云；李俊桦；基于原核微生物高通量测序数据准确识别单核苷酸多态性的分析软件，2017SR061659，原始取得，全部权利，2017-2-28.
5. 赵海龙；李芳；李晓云；李俊桦；原核微生物插入缺失片段的准确识别，2017SR061749，原始取得，全部权利，2017-2-28.
