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导师

刘传宇

刘传宇(liuchuanyu@genomics.cn),博士,基因组多维解析技术全国重点实验室研究员。现任华大生命科学研究院粤港澳分院院长、研究院生化所所长,华大集团华南区副总经理,深圳市数字化细胞病理概念验证中心主任。曾获中国博士后科学基金特别资助(一等资助),国家重点研发计划课题负责人。深圳市高层次人才,盐田区梧桐人才。代表性工作有单细胞多维组学技术scCAT-seq(Nature Communications, 2019),HT-scCAT-seq(Genome Biology, 2025),基于DNA纳米球的细胞组学技术Stereo-cell (Science, 2025),人类全能干细胞8CLC体外诱导(Nature, 2022a),非人灵长类动物单细胞转录组图谱绘制(Nature, 2022b),中国人群免疫多组学图谱CIMA (Science, 2026)。近5年在Science, Nature, Nature Communications, Cell Reports, Genome Biology等杂志发表论文67篇,其中第一作者或通讯作者32篇。申请国际发明专利22项(授权4项),中国发明专利18项(授权6项),软著7项。山西医科大学客座教授,中国计量大学、深圳大学、华中科技大学、安徽医科大学、河北医科大学、兰州大学、华中农业大学、东北林业大学、武汉理工大学研究生导师。

研究方向:细胞组学测序技术及应用研究

现任岗位:华大生命科学研究院 粤港澳分院 院长

教育背景:中国科学院大学 基因组学 博士

代表性科研项目:

1. 国家科技部,国家重点研发计划-“前沿生物技术”重点专项,大规模细胞多模态多组学数据集构建(2025YFC3409302,课题),2025-09至今,1200万元,在研,主持

2. 深圳市创新创业专项,深圳市数字化细胞病理概念验证中心(深科创资〔2024〕59号),2022-01至今 (载体性质),300万元,在研,主持

3. 广东省基础与应用基础研究基金委员会,省企联合基金-重点项目,基于多组学技术的脓毒症免疫功能紊乱评价标志物体系构建及靶向干预机制研究(2024B1515230003),2024-11 至今,50万元,在研,骨干

4. 国家科技部,国家重点研发计划-“前沿生物技术”重点专项, 高精度全景转录组深度解析技术(2022YFC3400400), 2022-11至今,4000万元,在研,骨干

5. 中国博士后科学基金一等资助,基于单细胞多组学测序技术的新冠肺炎患者免疫细胞异质性响应研究(2020T130080ZX), 2020-08至2021-05,18万元,结题,主持

代表性论文:

1. Jianhua Yin#, Yuhui Zheng#, Zhuoli Huang#, Wenwen Zhou#, Yue Yuan#, Pengfei Cai#, Yong Bai#,..., Yanan Cao*, Xun Xu*, Longqi Liu*, Xin Jin*, Chuanyu Liu*. Chinese Immune Multi-Omics Atlas. Science (In press), 2026. (*通讯作者)

2. Sha Liao#, Xiaoxi Zhou#, Chuanyu Liu#, Chang Liu#, Shijie Hao#, Hongyu Luo#,..., Longqi Liu*, Ao Chen*, Xun Xu*. Stereo-cell: spatial enhanced resolution single-cell sequencing with high-density DNA nanoball-patterned arrays. Science 2025,389(6762):eadr0475. (#第一作者)

3. Md Abdul Mazid#*, Carl Ward#, Zhiwei Luo#, Chuanyu Liu#,..., Longqi Liu*, Wenjuan Li*, Miguel A Esteban*. Rolling back human pluripotent stem cells to an eight-cell embryo-like stage. Nature 2022, 605: 315-324. (#第一作者)

4. Lei Han#, Xiaoyu Wei#, Chuanyu Liu#, Giacomo Volpe#, Zhenkun Zhuang#, Xuanxuan Zou#, Zhifeng Wang#,..., Yong Hou*, Xun Xu*, Miguel A Esteban*, Longqi Liu*. Cell transcriptomic atlas of the non-human primate Macaca fascicularis. Nature 2022, 604: 723-731. (#第一作者)

5. Longqi Liu#, Chuanyu Liu#, Andrés Quintero#, Liang Wu#, Yue Yuan#,...,Roland Eils*, Zhouchun Shang*, Xun Xu*. Deconvolution of single-cell multi-omics layers reveals regulatory heterogeneity. Nature Communications 2019, 10: 470. (#第一作者)

6. Longqi Liu#, Lizhi Leng#, Chuanyu Liu#, Changfu Lu#, Yue Yuan#, ..., Zhouchun Shang*, Ge Lin*. An integrated chromatin accessibility and transcriptome landscape of human pre-implantation embryos. Nature Communications 2019, 10(1): 364. (#第一作者)

7. Qiuting Deng#, Pengfei Cai#, Yingjie Luo#, Zhongjin Zhang#,..., Longqi Liu*, Yue Yuan*, Chuanyu Liu*. Deciphering gene regulatory programs in mouse embryonic skin through single-cell multiomics analysis. Genome Biology 2025, 26(1):187.(*通讯作者)

8. Jianhua Yin#, Jingzhi Lv#, Shichen Yang#, Yang Wang#,..., Jun Cao*, Chuanyu Liu*, Xin Jin*, Jian Wang*. Multi-omics reveals immune response and metabolic profiles during high-altitude mountaineering. Cell Reports 2025, 44: 115134. (*通讯作者)

9. Yong Bai#*, Xiangyu Guo#, Keyin Liu#,..., Chuanyu Liu*, Xin Jin*. SpaSEG: unsupervised deep learning for multi-task analysis of spatially resolved transcriptomics. Genome Biology 2025, 26(1):230. (*通讯作者)

10. Peiyao Ma#, Shanshan Duan#,..., Yue Yuan*, Chuanyu Liu*. Single-cell chromatin accessibility landscape profiling reveals the diversity of epigenetic regulation in the rat nervous system. Scientific Data 2025, 12(1):140. (*通讯作者)

授权专利:

1. 王全磊;商周春;葛玉萍;刘聪;吴亮;董国艺;刘传宇;郑俊强,一种临床级胎盘间充质干细胞制备方法(ZL201410377209.X),授权日期2019/02/12,发明专利,中国

2. 王全磊;商周春;葛玉萍;刘聪;吴亮;董国艺;刘传宇;郑俊强,一種臨床級胎盤間充質幹細胞製備方法(HK1216260),授权日期2019/10/25,发明专利,中国香港

3. 刘龙奇;刘传宇;吴亮;商周春;成梦南;袁月;徐礼钦;刘心;徐讯,单细胞测序文库的构建方法及其应用(ZL201680091050.2),授权日期2023/08/29,发明专利,中国

4. Longqi Liu;Chuanyu Liu;Liang Wu;Zhouchun Shang;Mengnan Cheng;Yue Yuan; Jiangshan Xu;Xin Liu;Xun Xu,METHOD FOR CONSTRUCTING SINGLE CELL SEQUENCING LIBRARY AND USE THEREOF(EP3553180),授权日期2022/05/04,发明专利,欧洲

5. Longqi Liu;Chuanyu Liu;Liang Wu;Zhouchun Shang;Mengnan Cheng;Yue Yuan; Jiangshan Xu;Xin Liu;Xun Xu,METHOD FOR CONSTRUCTING SINGLE CELL SEQUENCING LIBRARY AND USE THEREOF(US11434483B2),授权日期2022/09/06,发明专利,美国

6. 王明月;刘龙奇;刘传宇;吴亮;许江山;袁月;商周春,一种体液游离DNA的文库构建方法及其应用(ZL201780097208.1),授权日期2024/11/12,发明专利,中国

7. Mingyue Wang;Longqi Liu;Chuanyu Liu;Liang Wu;Jiangshan Xu;Yue Yuan;Zhouchun Shang,METHOD FOR CONSTRUCTING LIBRARY OF CELL-FREE DNAS IN BODY FLUIDS AND APPLICATION THEREOF(EP3719182),授权日期2022/11/23,发明专利,欧洲

8. Mingyue Wang;Longqi Liu;Chuanyu Liu;Liang Wu;Jiangshan Xu;Yue Yuan;Zhouchun Shang,METHOD FOR CONSTRUCTING LIBRARY OF CELL-FREE DNAS IN BODY FLUIDS AND APPLICATION THEREOF(US12104203B2),授权日期2024/10/01,发明专利,美国

9. 刘传宇;刘龙奇;黄亚灵;袁月;王明月;魏小雨;王姗姗;王春青,基于液滴微流控的单细胞测序及应用(ZL202080091329.7),授权日期2025/03/04,发明专利,中国

10. 刘传宇;刘龙奇;黄亚灵;袁月;王明月;魏小雨;王姗姗;王春青,基於液滴微流控的單細胞測序及應用(HK40070111),授权日期2025/08/29,发明专利,中国香港

ORCID链接:https://orcid.org/0000-0003-2258-0897 

Google Scholar链接:

https://scholar.google.com/citations?hl=en&view_op=list_works&gmla=AJsN-F7lRx8ltzdyv2cMB-67mijWJcEl0Y7pd3huasIE9P4aHDDNZuuiKRKWMQb-rYI_MG8gIHzl4_rWQDQcZe-9HYUsYcZvqhTrCXFyKg0yGszx7KZsSwI&user=x55nGmYAAAAJ


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