李美（limei1@genomics.cn）。时空工具专项科学家，主要从事测序工具和时空工具算法研发工作，2014加入华大以来主导测序仪的Basecalling软件算法研发，包括BGISEQ500、MGISEQ2000、MGISEQ200，以及DNBSEQ TX系列测序仪。目前致力于时空工具算法研发，提供Stereo-seq数据获取和解读全流程算法和解决方案，已完成时空单细胞分辨率数据获取解决方案和3D重构解决方案上线，后续主要方向为空间多组学单细胞分辨率解决方案和空间测序数据解析工具研发，主要的研究领域包括空间多组学方向的图像处理（多模态）和数据挖掘。
研究方向：信号与信息处理
现任岗位：专项科学家/算法开发高级工程师
教育背景：博士，生物医学工程，丹麦技术大学
参与项目:
1.空间组学-phase I
2.科技部, 国家重点研发计划, 2021YFF1200105, 面向生物大数据的DNA存储系统集成与应用示范,2021-12 至 2024-11, 3000万元, 在研, 参与
论文:
1. Li, M. et al. CellBin: a highly accurate single-cell gene expression processing pipeline for high-resolution spatial transcriptomics. biorxiv (2023) doi:10.1101/2023.02.28.530414
2. Bohan Zhang,Mei Li,Qiang Kang,Zhonghan Deng,Hua Qin,Kui Su,Xiuwen Feng,Lichuan Chen,Huanlin Liu,Shuangsang Fang,Yong Zhang,Yuxiang Li,Susanne Brix,Xun Xu,Generating single-cell gene expression profiles for high-resolution spatial transcriptomics based on cell boundary images,Gigabyte,2024 https://doi.org/10.46471/gigabyte.110
3. Tongxuan Lv, Ying Zhang, Mei Li, Qiang Kang, Shuangsang Fang, Yong Zhang, Susanne Brix, Xun Xu, EAGS: efficient and adaptive Gaussian smoothing applied to high-resolved spatial transcriptomics, GigaScience, Volume 13, 2024, giad097, https://doi.org/10.1093/gigascience/giad097
专利:
1.李美; 黎宇翔; 刘逸文 ; 荧光图像配准方法、基因测序仪及系统、存储介质, 2022-1-20, 其他国家,AU2018418609 (专利)
2.李美; 刘焕林; 李敏; 岑伟轩; 黄子睿; 邓忠寒; 苏奎; 李泽鹏; 冯柠; 姜琪琛; 吴逸文; 康强; 黎宇翔; 张勇; 徐讯 ; 空间组学单细胞数据获取方法及装置和电子设备, 2022-12-5, 中国,PCT/CN2022/136698 (专利)
3.李美; 黎宇翔; 刘逸文 ; 荧光图像配准方法、基因测序仪及系统、存储介质, 2018-4-10, 中国,PCT/CN2018/082578 (专利)
4.李敏; 李美; 黎宇翔 ; 基因图像数据校正方法、系统、电子设备及存储介质, 2022-12-5, 中国,PCT/CN2022/136672 (专利)
5.张博涵; 李美; 张勇; 黎宇翔 ; 一种组织细胞处理方法、装置、电子设备及存储介质, 2022-12-5,中国, PCT/CN2022/136568 (专利)
6.张博涵; 陈立川; 李美; 张勇; 黎宇翔 ; 细胞染色试剂及其在细胞转录组分析中的应用, 2022-12-5,中国, PCT/CN2022/136569 (专利)
7.黄子睿; 刘伟庆; 李美; 黎宇翔 ; 细胞分割的处理方法、装置及电子设备, 2022-12-5, 中国,PCT/CN2022/136657 (专利)
8.姜琪琛; 李敏; 李美; 黎宇翔; 张勇 ; 样本图像的组织分割方法、系统、设备及介质, 2022-12-5,中国, PCT/CN2022/136664 (专利)
9. 吴逸文; 李敏; 李美; 黎宇翔 ; 基因图像数据校正方法、系统、电子设备及存储介质, 2022-12-5,中国, PCT/CN2022/136670 (专利)
