范广益（fanguangyi@genomics.cn）。博士，致力于在比较基因组学和生物信息学领域持续深耕，主攻分子和细胞层面的跨物种比较分析工具的开发。具备良好的团队合作能力和项目管理能力，能高效组织和领导科研项目，主导发起“万种鱼类基因组学”、“万种软体动物基因组学”和“全球海洋微生物基因组学”等基因组研究计划，推动了相关领域的研究进展。主编并发布了年度海洋生物基因组学研究进展报告《海洋生物基因组学白皮书》。截止到2023年12月，在Nature、Science、Cell等国际知名学术刊物上发表科学论文130余篇，其中以第一作者或通讯作者（含共同）发表的论文40余篇，累积引用次数11000余次，担任国际知名学术杂志审稿人，积极参与学术交流与合作。2021年作为负责人获得国家自然科学基金面上项目资助, 累计主持/参加国家省市基金项目10余项。受邀成为中国海洋发展研究会海洋生物技术分会执行主任、中国海洋工程咨询协会深海技术与工程分会委员。
研究方向：基因组学，生物信息学，分子遗传学
现任岗位：华大研究院青岛分院院长
教育背景：澳门大学生物医药博士
研究摘要
1.比较基因组学
2.群体遗传学
3.比较细胞组学
4.生物信息学
参与项目
1.海水鱼类耐盐性状与肠道菌群的遗传关系；
2.肺表面活性剂蛋白介导非洲肺鱼鳃肺呼吸转换的分子机制；
3.对澳门红树林植物内生菌多样性及其代谢物的研究；
4.脊椎动物呼吸器官发育相关的保守非编码元件演化及功能研究；
5.千种海洋生物基因测序
论文
1.Chen J, Jia Y, Sun Y, Liu K, Zhou C, Liu C, Li D, Liu G, Zhang C, Yang T, Huang L, Zhuang Y, Wang D, Xu D, Zhong Q, Guo Y, Li A, Seim I, Jiang L, Wang L, Lee SMY, Liu Y, Wang D, Zhang G, Liu S, Wei X, Yue Z, Zheng S, Shen X, Wang S, Qi C, Chen J, Ye C, Zhao F, Wang J, Fan J, Li B, Sun J, Jia X, Xia Z, Zhang H, Liu J, Zheng Y, Liu X, Wang J, Yang H, Kristiansen K, Xu X, Mock T, Li S, Zhang W, Fan G. Global marine microbial diversity and its potential in bioprospecting. Nature. 2024 Sep.
2.Tian R, Zhang Y, Kang H, Zhang F, Jin Z, Wang J, Zhang P, Zhou X, Lanyon JM, Sneath HL, Woolford L, Fan G, Li S, Seim I. Sirenian genomes illuminate the evolution of fully aquatic species within the mammalian superorder afrotheria. Nat Commun. 2024 Jul 2.
3.Hoelzel AR, Gkafas GA, Kang H, Sarigol F, Le Boeuf B, Costa DP, Beltran RS, Reiter J, Robinson PW, McInerney N, Seim I, Sun S, Fan G, Li S. Genomics of post-bottleneck recovery in the northern elephant seal. Nat Ecol Evol. 2024 Apr.
4. Jiang A, Han K, Wei J, Su X, Wang R, Zhang W, Liu X, Qiao J, Liu P, Liu Q, Zhang J, Zhang N, Ge Y, Zhuang Y, Yu H, Wang S, Chen K, Lu W, Xu X, Yang H, Fan G, Dong B. Spatially resolved single-cell atlas of ascidian endostyle provides insight into the origin of vertebrate pharyngeal organs. Sci Adv. 2024 Mar 29.
5.Zhang H, Wang X, Qu M, Yu H, Yin J, Liu X, Liu Y, Zhang B, Zhang Y, Wei Z, Yang F, Wang J, Shi C, Fan G, Sun J, Long L, Hutchins DA, Bowler C, Lin S, Wang D, Lin Q. Genome of Halimeda opuntia reveals differentiation of subgenomes and molecular bases of multinucleation and calcification in algae.Proc Natl Acad Sci U S A. 2024 Sep 24.
6.Huang Y, Liu X, Li S, Li C, Wang HY, Liu Q, Chen JY, Zhang Y, Li Y, Zhang X, Wang Q, Liu K, Liu YY, Pang Y, Liu S, Fan G, Shao C. Discovery of an unconventional lamprey lymphocyte lineage highlights divergent features in vertebrate adaptive immune system evolution.Nat Commun. 2024 Sep 3.
7.Wang HY, Chen JY, Li Y, Zhang X, Liu X, Lu Y, He H, Li Y, Chen H, Liu Q, Huang Y, Jia Z, Li S, Zhang Y, Han S, Jiang S, Yang M, Zhang Y, Zhou L, Tan F, Ji Q, Meng L, Wang R, Liu Y, Liu K, Wang Q, Seim I, Zou J, Fan G, Liu S, Shao C. Single-cell RNA sequencing illuminates the ontogeny, conservation and diversification of cartilaginous and bony fish lymphocytes.Nat Commun. 2024 Sep 3.
8.Chen J, Jia Y, Sun Y, Liu K, Zhou C, Liu C, Li D, Liu G, Zhang C, Yang T, Huang L, Zhuang Y, Wang D, Xu D, Zhong Q, Guo Y, Li A, Seim I, Jiang L, Wang L, Lee SMY, Liu Y, Wang D, Zhang G, Liu S, Wei X, Yue Z, Zheng S, Shen X, Wang S, Qi C, Chen J, Ye C, Zhao F, Wang J, Fan J, Li B, Sun J, Jia X, Xia Z, Zhang H, Liu J, Zheng Y, Liu X, Wang J, Yang H, Kristiansen K, Xu X, Mock T, Li S, Zhang W, Fan G. Global marine microbial diversity and its potential in bioprospecting.Nature. 2024 Sep.
9.Chen J, Peng L, Zhou C, Li L, Ge Q, Shi C, Guo W, Guo T, Jiang L, Zhang Z, Fan G, Zhang W, Kristiansen K, Jia Y. Datasets of fungal diversity and pseudo-chromosomal genomes of mangrove rhizosphere soil in China.Sci Data. 2024 Aug 20.
10.Wang W, Ge Q, Wen J, Zhang H, Guo Y, Li Z, Xu Y, Ji D, Chen C, Guo L, Xu M, Shi C, Fan G, Xie C. Horizontal gene transfer and symbiotic microorganisms regulate the adaptive evolution of intertidal algae, Porphyra sense lato.Commun Biol. 2024 Aug 11.
其他科研论文查看链接： https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/?term=guangyi+fan&sort=pubdate
专利
1.郭立东; 邓礼; 徐梦阳; 范广益 ; stLFR GapCloserV1.0, 2020SR0256579, 原始取得, 全部权利, 2019-7-24 (软件著作权)
2.郭立东; 徐梦阳; 邓礼; 范广益 ; FABuLOUS GapCloserV1.0, 2020SR0288206, 原始取得, 全部权利, 2019-9-19 (软件著作权)
3.郭立东; 徐梦阳; 范广益 ; HAST Assembler[简称:HAST]V1.0, 2021SR0523039, 原始取得, 全部权 利, 2020-6-1 (软件著作权)
4.齐彦伟; 邓礼; 郭立东; 张跃; 古盛强; 范广益 ; MetaTrass软件V1.0, 2022SR0138675, 原始取得, 全部权利, 2021-10-21 (软件著作权)
5.邓礼; 郭立东; 王文超; 徐梦阳; 范广益 ; 基于单管长片段测序数据进行骨架组装的方法和装置, 2019-6-25, 中国, 201910555693.3 (专利)
6.肖高泓; 邓礼; 齐彦伟; 郭立东; 范广益; 邵利彬; 周晶 ; 一种共标签测序数据的序列比对方法和装置, 2022-12-27, 中国, 202211682642.5 (专利)
Google Scholar链接：https://scholar.google.cz/citations?user=2p25J58AAAAJ&hl=zh-CN&oi=ao
