陈唯军（chenwj@genomics.cn）。博士，华大孵化产业平台火眼工程总经理，中国科学院大学教授、博士生导师。主要从事微生物基因组学及新发突发病原体检测新技术研究。开创的宏基因组学病原微生物分析技术是新发传染病病原发现领域重要的技术工具，已经通过该技术率先发现了包括发热伴血小板减少综合症的致病病原——新布尼亚病毒、2019年新型冠状病毒肺炎——SARS-CoV-2病毒、最新的狼牙病毒、湿地病毒等一系列新发传染病病原。先后主持、参与国家“973”、“863”、传染病专项、生物安全专项、国家重点研发计划、国家自然基金及中科院知识创新等数十项；获得国家和军队科技进步奖九项；申报及获得发明专利数十项；研发获得新药（医疗器械）证书100多个；在国际知名专业期刊发表论文100余篇，出版专著4部；获得中科院建院60周年成果先进个人、北京奥运会医疗卫生保障先进个人、中关村创新领军人才、深圳市A类人才、科技部科技抗疫先进个人等多项荣誉称号。学术兼职包括国家突发应急网络检测专班专家委员会委员、生物医学检验产业分会青年企业家委员会副主任委员，中国医促会分子诊断学分会常务委员，传染病防控技术学术委员会常务委员，卫生产业协会实验医学专委会委员等。
研究方向：基因组学、微生物基因组学、生物信息学、新发突发病原体检测新技术研究
现任岗位：华大孵化产业平台火眼工程总经理
教育背景：中科院基因组所博士
研究摘要
1. 呼吸系统感染与宿主反应特征标识筛查及重症预警研究
2. X疾病快速智能甄别体系研究
3. 基于一体化检测新技术研究及超敏鉴别试剂盒产业化应用
4. RSV MPox疫苗研发
参与项目
1. 突发急性传染病诊断试剂的研制
2. 基于宏基因组学高通量测序技术的新型冠状病毒超敏鉴别试剂盒产业化应用
3. 呼吸系统感染与宿主反应特征标识筛查及快速检测方法研究
4. 基于新型宏转录组技术的虫媒未知病原体发现及其潜在致病性评估
5. 磷酸氯喹入组患者生物样本的测试
6. 基于核酸检测和宏基因组测序的2019新型冠状病毒溯源研究
论文
1. Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding.
2. Multicenter assessment of shotgun metagenomics for pathogen detection.EBioMedicine.
3. Multiple approaches for massively parallel sequencing ofSARS-CoV-2 genomes directly from clinical samples.
4. Profile ofspecific antibodies to the SARS-CoV-2
5. Cell-free DNA as a diagnostic tool for human echinococcosis.
6. Total infectomes of 162 SARS-CoV-2 cases using meta-transcriptomic sequencing.
7. Population Bottlenecks and Intra-host Evolution During Human-to-Human Transmission of SARS-CoV-2.
8. Characterization of respiratory microbial dysbiosis in hospitalized COVID-19 patients
9. Coronavirus disease 2019 (COVID-19): diagnosis and prognosis.
10. Collaborated effort against SARS-CoV-2 outbreak in China
11. Intra-host variation and evolutionary dynamics of SARS-CoV-2 populations in COVID-19 patients.
12. The Origin and Molecular Epidemiology of Dengue Fever in Hainan Province, China, 2019
13. Characterizing dynamic changes of plasma cell-free Echinococcus granulosus DNA before and after cystic echinococcosis treatment initiation.
14. The epidemic of Q fever in 2018 to 2019 in Zhuhai city of China determined by metagenomic next-generation sequencing.
15. Longitudinal Study of the Drug Resistance in <i>Klebsiella pneumoniae</i> of a Tertiary Hospital, China: Phenotypic Epidemiology Analysis (2013-2018).
16. Systematic profiling of SARS- CoV-2-specific IgG responses elicited by an inactivated virus vaccine identifies peptides and proteins for predicting vaccination efficacy.
17. A Path toward SARS-CoV-2 Attenuation: Metabolic Pressure on CTP Synthesis Rules the Virus Evolution.
18. Comprehensive characterization of plasma cell-free Echinococcus spp. DNA in echinococcosis patients using ultra-high-throughput sequencing.
19. A novel RFLP-ARMS TaqMan PCR-based method for detecting the BRAF V600E mutation in melanoma.
20. Detection of Zaire Ebola virus by real-time reverse transcription-polymerase chain reaction, Sierra Leone
专利
1. 检测呼吸道病原体的方法和试剂盒
2. 一种检测消化道病原体的方法
3. 检测自身免疫疾病相关抗体谱的微阵列—酶联免疫检测试剂盒
4. 一种丙型肝炎病毒核酸检测阳性指控品及标准品制备方法
5. 一种检测虫媒脑炎病毒的新技术
6. 非典型性肺炎病毒特异蛋白质和临床检测的方法及试剂盒
7. 隔离病房模块
8. 隔离病房搭建系统
9. 负压隔离房
10. 构建用于手足口样本归类的模型的方法及其应用
11. 基因突变和B-raf基因点突变V600E的一步检测方法及试剂盒
12. 一种基于Blocker引物和ARMS引物检测基因突变的方法和试剂盒
13. 一种基于ARMS荧光定量PCR检测基因突变的试剂盒和方法
14. 基于近红外荧光纳米微球标记物的免疫层析定量检测试剂
15. 基于高通量测序的标记和捕获多个样本的一个或多个特定基因的方法和试剂盒
16. 检测表皮生长因子受体基因外显子19缺失突变和外显子21点突变的方法
