蔡鹏飞（caipengfei@genomics.cn）。博士，华大研究院杭州分院细胞所生物信息副研究员。
研究方向：1）基于大人群队列的多组学细胞图谱构建；2）利用组学大数据与人工智能方法构建人类衰老与疾病的预测诊断模型；3）基于二代和三代测序的单细胞时空组学技术研发
现任岗位：华大研究院杭州分院细胞所生物信息副研究员
教育背景：中国科学技术大学生物信息博士
研究摘要
1、通过收集不同背景、不同年龄、不同疾病条件下的志愿者队列样本，包括患病部位、外周血等组织样本，进行单细胞多组学测序，同时收集问卷体检、代谢、脂质、生化等多维度临床信息，旨在建立围绕中心法则的全景细胞分子图谱，建立时空背景下的宏观与微观表型联系，为理解衰老与疾病的普遍规律构建基本模型。
2、目前的医疗临床检验主要依赖于体检和图像检测，但仍存在灵敏度和特异性不足、分辨率和精度较差、缺乏早期检测标志物等问题。为了克服这些医学挑战，基于华大自主研发的Stereo-cell和第三代测序技术Cyclone-seq，我们拟构建一套以单细胞分辨率的原位图像染色和对应基因检测为核心的病理数据库。结合人工智能算法，这一系统能够显著提升诊断的准确性和效率，提供更早期、更精准的疾病诊断和风险评估，从而克服传统方法的局限性。
参与项目
1、基于人群队列（健康、疫苗、疾病与感染）的外周免疫图谱研究
2、单细胞多组学技术HT-scCAT-seq及相应算法研发
3、人类微血管的空间细胞图谱构建以及血管屏障微结构解析研究
论文
1.Pengfei Cai*, Auke B.C. Otten*, Binbin Cheng, Mitsuhiro A. Ishii, Wen Zhang, Beibei Huang, Kun Qu# & Bryan K. Sun#. A genome-wide long noncoding RNA CRISPRi screen identifies PRANCR as a novel regulator of epidermal homeostasis, Genome Research, 2020.
2.Chuang Guo*, Pengfei Cai*, Liying Jin*, Qing Sha, Qiaoni Yu, Wen Zhang, Chen Jiang, Qian Liu, Dandan Zong, Kun Li, Jingwen Fang, Fangting Lu, Yanshi Wang, Daojing Li, Jun Lin, Lu Li, Zhutian Zeng, Xianhong Tong, Haiming Wei, Kun Qu#. Single-cell profiling of the human decidual immune microenvironment in patients with recurrent pregnancy loss, Cell Discovery, 2021.
3.Xianwen Ren*, Wen Wen*, Xiaoying Fan*, Wenhong Hou*, Bin Su*, Pengfei Cai*, Jiesheng Li*, Yang Liu*, Fei Tang*, Fan Zhang*, Yu Yang*, Jiangping He*, Wenji Ma*, Jingjing He*, Pingping Wang* et al., COVID-19 immune features revealed by a large-scale single cell transcriptome atlas, Cell, 2021
Google scholar链接：https://scholar.google.com/citations?user=VA-4WX4AAAAJ&hl=en
