夏科科（xiakeke@genomics.cn）。博士，副研究员，华大生命科学研究院 主任科学家，深圳市高层次专业人才，2016年博士毕业于中国农业大学。其研究致力于植物基因组“读”、“写”技术的研发和贯穿应用，以支撑多年生超级作物的创新育种研究。在基因组“读”方向，他负责开发了首个真正的单细胞空间转录组技术，并构建了首个拟南芥叶片的单细胞空间转录组图谱，与同期时空组学研究成果共同被评为“2022年中国生命科学十大进展”。近年已在Developmental cell和PNAS等期刊发表论文9篇，申请发明专利6项。
研究方向：目前，其主导多种植物时空组学技术研发及在植物器官演化发育、植物环境互作和植物代谢物合成运输等领域的应用，其中在植物干细胞和器官再生领域已取得多项突破发现。在基因组“写”方向，专注于基因编辑、万能接头和细胞融合技术研发和机制研究，以突破远缘杂交和远缘嫁接技术难题；其负责开发了蝴蝶兰基因组编辑技术和自发光番茄、烟草和蝴蝶兰的创制技术；其目前正在研发植物自动化基因操控系统及应用，以实现自动化、智能化、信息化的组织培养、遗传转化、基因编辑、筛选鉴定和表型分选等操作，该系统将大幅提高作物基因编辑育种的通量、缩短编辑周期、和节省人力消耗。
现任岗位：华大研究院主任科学家
教育背景：博士，生物化学与分子生物学，中国农业大学
论文
1.Yin, R.L., Chen, R.Y., Xia, K.K., and Xu, X. (2024) A Single-cell transcriptome atlas reveals the trajectory of early cell fate transition during callus induction in Arabidopsis. Plant communications. DOI:10.1016/j.xplc.2024.100941.
2.Yin, R.L., Xia, K.K., and Xu, X. (2023). Spatial transcriptomics drives a new era in plant research. Plant Journal 116, 1571-1581.
3.Song, X., Guo, P., Xia, K., Wang, M., Liu, Y., Chen, L., Zhang, J., Xu, M., Liu, N., Yue, Z., et al. (2023). Spatial transcriptomics reveals light-induced chlorenchyma cells involved in promoting shoot regeneration in tomato callus. Proceedings of the National Academy of Sciences 120, e2310163120.
4.Liu, P., Ye, D.-M., Chen, M., Zhang, J., Huang, X.-H., Shen, L.-L., Xia, K.-K., Xu, X.-J., Xu, Y.-C., Guo, Y.-L., et al. (2022). Scaling-up and proteomic analysis reveals photosynthetic and metabolic insights toward prolonged H2 photoproduction in Chlamydomonas hpm91 mutant lacking proton gradient regulation 5 (PGR5). Photosynthesis Research.
5.Xia, K., Sun, H.-X., Li, J., Li, J., Zhao, Y., Chen, L., Qin, C., Chen, R., Chen, Z., Liu, G., et al. (2022a). The single-cell stereo-seq reveals region-specific cell subtypes and transcriptome profiling in Arabidopsis leaves. Developmental cell 57, 1299-1310.e1294.
6.Xia, K., Zhang, D., Xu, X., Liu, G., Yang, Y., Chen, Z., Wang, X., Zhang, G.-Q., Sun, H.-X., and Gu, Y. (2022b). Protoplast technology enables the identification of efficient multiplex genome editing tools in Phalaenopsis. Plant Science 322, 111368.
7.Xia, K., Liu, D.-K., and Wang, J.-Y. (2021). The complete chloroplast genome sequence of Phalaenopsis wilsoniii (Orchidaceae). Mitochondrial DNA Part B 6, 3303-3305.
8.Xia, K., Wang, B., Zhang, J., Li, Y., Yang, H., and Ren, D. (2017). Arabidopsis phosphoinositide-specific phospholipase C 4 negatively regulates seedling salt tolerance. Plant Cell Environ 40, 1317-1331.
9.Zhang, J., Xia, K., Yang, Y., and Yang, H. (2015). Overexpression of Arabidopsis phosphoinositide-specific phospholipase C5 induces leaf senescence. Plant Cell Tiss Organ Cult 120, 585-595.
