陈铎元（chenduoyuan@genomics.cn），本科毕业于四川大学生物技术基地班，博士毕业于复旦大学生物信息学专业，具有多年资深生物信息分析多组学经验。现在杭州华大基因任生物信息副研究员兼博士后，主要开展跨物种比较基因组学、比较时空组学、神经科学等领域方向，并拓展进行相关算法开发与集成。已在Cell Discovery（IF=38）、Bioinformatics等杂志上以第一作者发表多篇论文，并参与两个国自然项目。目前主要负责开展脑专项中跨物种脑演化比较项目，进行从低等海洋生物到鸟类、哺乳类人类等高等动物脑精细单细胞与空间转录组分析解读
研究方向：脑科学、比较时空组学
现任岗位：杭州华大研究院 脑科学 生物信息副研究员
教育背景： 复旦大学生命科学学院生物信息学博士
研究摘要
结合比较基因组学、系统发育学理论，采用单细胞、空间组大脑精细切片数据，进行跨越整个低等动物到脊椎动物的大脑脑区、细胞类型演化比较分析，从而解读意识起源的进化历史，充分理解各脑区细胞类型演化差异与功能分化。
参与项目
1.基于比较时空组学解读羊膜类动物大脑细胞类型跨物种演化历史
2.基于空间组学解读哺乳类大脑海马区跨物种差异
3.海马成年神经发生机制的解读与分析
4.低等、原生生物神经系统起源历史的解读
5.基于GCN的多物种细胞类型映射与比较算法开发
论文
1.Zhao Y*, Chen D*, Tang J, Zheng Y, Qi J, Wang H. Parental folate deficiency induces birth defects in mice accompanied with increased de novo mutations. Cell Discov. 2022 Feb 22;8(1):18.（IF=38.079）
2.Duoyuan C , Taikui Z , Yamao C , et al. Tree2GD: a phylogenomic method to detect large-scale gene duplication events[J]. Bioinformatics, 2022. （IF=6.931）
3.Liu Pan*, Chen Duoyuan*, Zhang Shouyue, Zhou Rui, Ren Wen, Ouyang Liang and He Gu, Organocatalytic Diastereoselective Multicomponent Domino Knoevenagel/Diels-Alder Reaction: Synthesis of Densely Functionalized Spiro[5.5]undecane, Current Organic Synthesis 2015; 12(1) .（IF=2.276）
4.Chien sun Huang, Qi X , Chen D , et al. Recurrent genome duplication events likely contributed to both the ancient and recent rise of ferns[J]. Journal of Integrative Plant Biology, 2020.
5.Xian Q, Rui S, Yang W, et al. Genome-wide Target Enrichment-aided Chip Design: a 66 K SNP Chip for Cashmere Goat[J]. Scientific Reports, 2017, 7.
专利
1.软著：SC-Entropy-基于信息熵理论的多组学跨物种细胞类型注释与保守性评估软件
