曹磊（caolei2@genomics.cn），北京师范大学硕士，北京华大时空算法开发工程师。以共同第一作者在生物算法分析领域发表论文4篇，申请专利1篇。参与开发时空组数据分析工具包stereopy，目前致力于知识图谱在生信分析中的应用。
研究方向：生物信息
现任岗位：算法开发工程师
教育背景：硕士，生物信息学， 北京师范大学
研究摘要：
1.时空单细胞组学算法研发。包括细胞分群，细胞注释，轨迹推断等分析任务的研发。（GigaScience,2024; bioRxiv，2023）
2.知识图谱算法研发。收集整理生物医学领域知识图谱，利用大语言模型进行知识图谱应用。
论文：
1.Lei Cao, Chao Yang, Luni Hu, Wenjian Jiang, Yating Ren, Tianyi Xia, Mengyang Xu, Yishuai Ji, Mei Li, Xun Xu, Yuxiang Li, Yong Zhang, Shuangsang Fang, Deciphering spatial domains from spatially resolved transcriptomics with Siamese graph autoencoder, GigaScience, Volume 13, 2024, giae003, https://doi.org/10.1093/gigascience/giae003
2.Cao L, Zhang Q, Song H, Lin K, Pang E. DeepASmRNA: Reference-free prediction of alternative splicing events with a scalable and interpretable deep learning model. iScience. 2022 Oct 14;25(11):105345. doi: 10.1016/j.isci.2022.105345. PMID: 36325068; PMCID: PMC9619290.
3.Zhang WP, Cao L, Lin XR, Ding YM, Liang Y, Zhang DY, Pang EL, Renner SS, Bai WN. Dead-End Hybridization in Walnut Trees Revealed by Large-Scale Genomic Sequence Data. Mol Biol Evol. 2022 Jan 7;39(1):msab308. doi: 10.1093/molbev/msab308. PMID: 34687315; PMCID: PMC8760940.
