华大教育中心设有院长1名，在集团创始人中推荐产生；设常务副院长1名，主持学院日常工作；视工作开展需要，设副院长2-4名。

院长-杨焕明

        现任华大集团董事、理事长。中国科学院院士，中国医学科学院学部委员，发展中国家科学院（TWAS）院士，以及美国国家科学院、德国国家科学院、印度国家科学院、丹麦皇家科学院、欧洲分子生物学组织（EMBO）外籍成员。中国科学院及中国医学科学院教授。杨焕明于丹麦哥本哈根大学获博士学位。后在法国、美国从事博士后研究。统筹负责学院整体工作。

副院长-高强

        于山东大学获细胞生物学博士，负责学院国内教育合作、招生、资源平台和对外培训工作。

副院长-杨东声

        于香港大学获教育学博士，负责学院整体运营工作，兼任培养工作部负责人，统筹管理师资、教学、培养等工作。

副院长-肖敏凤

        于香港大学获微生物学博士，负责学院创新人才教育管理工作，兼任国际事业部负责人，统筹管理国际合作、国际教育、学院宣传等工作。